20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0228 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0228  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  978    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.318779  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0978  hypothetical protein  42.71 
 
 		 425 aa  338  9.999999999999999e-92  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2658  hypothetical protein  42.31 
 
 		 431 aa  327  2.0000000000000001e-88  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0995  VacJ-like lipoprotein  38.68 
 
 		 747 aa  314  1.9999999999999998e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.4612 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1774  hypothetical protein  34.94 
 
 		 429 aa  283  5.000000000000001e-75  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000898426  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22310  hypothetical protein  38.35 
 
 		 453 aa  277  3e-73  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0322432  hitchhiker  1.27053e-18 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1887  hypothetical protein  37.88 
 
 		 453 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2691  hypothetical protein  38.46 
 
 		 428 aa  270  5.9999999999999995e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1240  putative serine protein kinase, PrkA  37.28 
 
 		 432 aa  265  1e-69  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.585317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2364  hypothetical protein  36.5 
 
 		 430 aa  261  1e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3759  hypothetical protein  36.39 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.871717  normal  0.122794 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1621  hypothetical protein  36.88 
 
 		 432 aa  258  1e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1854  hypothetical protein  35.75 
 
 		 430 aa  256  9e-67  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.590447 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1288  hypothetical protein  36.05 
 
 		 432 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1603  hypothetical protein  36.32 
 
 		 432 aa  254  3e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0980837  normal  0.685434 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1330  hypothetical protein  36.05 
 
 		 432 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.12683  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1738  hypothetical protein  36.05 
 
 		 432 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3981  hypothetical protein  35.8 
 
 		 432 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.480409  normal  0.573966 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35080  hypothetical protein  35.54 
 
 		 432 aa  248  2e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.23636  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2131  hypothetical protein  26.89 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0712183  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>