More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5094 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5094  beta-lactamase  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  0.769745 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  48.92 
 
 		 414 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  46.62 
 
 		 406 aa  124  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  47.76 
 
 		 417 aa  122  8e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  46.27 
 
 		 405 aa  121  9e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  46.27 
 
 		 405 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  46.27 
 
 		 405 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  43.88 
 
 		 424 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  43.38 
 
 		 445 aa  112  4.0000000000000004e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  38.97 
 
 		 447 aa  109  4.0000000000000004e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  39.39 
 
 		 433 aa  103  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  37.23 
 
 		 452 aa  102  7e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  39.55 
 
 		 407 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  41.79 
 
 		 424 aa  101  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  42.54 
 
 		 414 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  35.57 
 
 		 427 aa  100  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  42.31 
 
 		 422 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  42.31 
 
 		 420 aa  99  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  39.1 
 
 		 411 aa  97.8  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  37.23 
 
 		 407 aa  97.8  2e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  36.91 
 
 		 419 aa  96.7  3e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  43.08 
 
 		 424 aa  96.3  4e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  40.29 
 
 		 402 aa  96.3  4e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  37.59 
 
 		 407 aa  95.1  9e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  37.23 
 
 		 453 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  41.04 
 
 		 424 aa  94.7  1e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  41.48 
 
 		 407 aa  95.1  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  41.54 
 
 		 418 aa  94.4  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  45.83 
 
 		 417 aa  93.2  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  40.31 
 
 		 399 aa  93.2  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  36.43 
 
 		 440 aa  92.8  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  42.22 
 
 		 426 aa  92  8e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  38.76 
 
 		 399 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  37.23 
 
 		 409 aa  90.9  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  37.32 
 
 		 425 aa  91.3  2e-17  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  33.78 
 
 		 438 aa  90.5  3e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  40.77 
 
 		 420 aa  90.1  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  36.09 
 
 		 407 aa  89.4  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  37.31 
 
 		 613 aa  89.4  5e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  32.07 
 
 		 435 aa  88.6  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  42.72 
 
 		 370 aa  88.2  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  35.12 
 
 		 412 aa  87.4  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  40 
 
 		 420 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  40 
 
 		 420 aa  87  2e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  40.3 
 
 		 408 aa  87.4  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  38.46 
 
 		 420 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  35.81 
 
 		 418 aa  86.7  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  36.81 
 
 		 415 aa  86.7  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  37.69 
 
 		 427 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  36.81 
 
 		 408 aa  85.9  5e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  40.15 
 
 		 410 aa  86.3  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  36.96 
 
 		 454 aa  85.5  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  37.12 
 
 		 438 aa  85.5  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3282  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  40.15 
 
 		 158 aa  84.3  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  33.57 
 
 		 411 aa  84.3  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  31.08 
 
 		 438 aa  84.3  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  40.54 
 
 		 401 aa  84  0.000000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  34.03 
 
 		 416 aa  83.6  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  32.87 
 
 		 411 aa  82.8  0.000000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0814  beta-lactamase  35.29 
 
 		 422 aa  83.2  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  42.34 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2338  beta-lactamase  37.41 
 
 		 406 aa  82.8  0.000000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0461598  normal  0.302776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  36.72 
 
 		 414 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  40.54 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  40.54 
 
 		 401 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  34.11 
 
 		 444 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  39.64 
 
 		 401 aa  80.1  0.00000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  34.88 
 
 		 436 aa  79.7  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  32.85 
 
 		 423 aa  79.3  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0582  beta-lactamase  28.75 
 
 		 431 aa  78.2  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0454  beta-lactamase  36.84 
 
 		 409 aa  77  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.174652 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  32.5 
 
 		 409 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  31.16 
 
 		 426 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  32.03 
 
 		 437 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  33.86 
 
 		 430 aa  76.3  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2251  beta-lactamase  27.92 
 
 		 432 aa  76.6  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0456  beta-lactamase  34.15 
 
 		 395 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  35.82 
 
 		 400 aa  76.3  0.0000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8863  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding protein  32.81 
 
 		 468 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  35.43 
 
 		 393 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3274  beta-lactamase  33.57 
 
 		 524 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.847415 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0831  beta-lactamase  31.45 
 
 		 422 aa  73.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.146809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  35.34 
 
 		 394 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02730  penicillin-binding protein, beta-lactamase class C  33.57 
 
 		 375 aa  73.2  0.000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.104017  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2676  Beta-lactamase  40.16 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.688851  normal  0.936004 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0961  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 431 aa  72.8  0.000000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.205968  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  34.65 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  36.22 
 
 		 396 aa  72  0.000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2230  beta-lactamase  33.54 
 
 		 380 aa  72  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  36.94 
 
 		 401 aa  71.6  0.00000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  39.81 
 
 		 389 aa  71.6  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  38.74 
 
 		 389 aa  70.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  31.25 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  31.25 
 
 		 440 aa  70.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  34.43 
 
 		 397 aa  69.7  0.00000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  29.46 
 
 		 431 aa  69.3  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  36.22 
 
 		 398 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1611  beta-lactamase  32.67 
 
 		 411 aa  68.2  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0866  beta-lactamase  27.27 
 
 		 382 aa  68.2  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6425  beta-lactamase  36.61 
 
 		 437 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.102177  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>