More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_3282 on replicon NC_009467
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009467  Acry_3282  Beta-lactamase class C and other penicillin binding protein-like protein  100 
 
 		 158 aa  319  9.999999999999999e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1842  beta-lactamase  54.86 
 
 		 418 aa  167  4e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.794756  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2359  beta-lactamase  51.41 
 
 		 411 aa  149  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.072295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2480  beta-lactamase  50.68 
 
 		 411 aa  148  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.26212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2209  beta-lactamase  47.71 
 
 		 420 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.683727  normal  0.729907 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5348  beta-lactamase  48.67 
 
 		 414 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.635001  normal  0.0848814 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3606  beta-lactamase  45.27 
 
 		 419 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000041879  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6088  beta-lactamase  50 
 
 		 406 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.496561  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3256  beta-lactamase  45.75 
 
 		 420 aa  124  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.748817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4601  beta-lactamase  43.33 
 
 		 427 aa  122  1e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.850083  normal  0.239148 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0831  beta-lactamase  44.9 
 
 		 445 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23283  normal  0.655791 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2440  beta-lactamase  45.1 
 
 		 422 aa  121  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4911  beta-lactamase  46.94 
 
 		 405 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366711  normal  0.312194 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6935  beta-lactamase  46.21 
 
 		 399 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4865  beta-lactamase  46.26 
 
 		 405 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00560097 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4402  beta-lactamase  46.26 
 
 		 405 aa  115  3e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.254761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3066  beta-lactamase  44.59 
 
 		 438 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2976  putative beta-lactamase class C and other penicillin binding proteins  46.21 
 
 		 399 aa  114  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2815  putative beta-lactamase  40 
 
 		 424 aa  113  1.0000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.211765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0637  beta-lactamase  42.47 
 
 		 424 aa  112  2.0000000000000002e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000302256  normal  0.230717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0349  beta-lactamase  44.22 
 
 		 407 aa  112  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1798  beta-lactamase  40.51 
 
 		 426 aa  112  3e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.491739  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2704  beta-lactamase  41.61 
 
 		 424 aa  111  4.0000000000000004e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.431746  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3749  beta-lactamase  48.2 
 
 		 401 aa  111  5e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0280744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2658  beta-lactamase  46.76 
 
 		 401 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0590  beta-lactamase  42.64 
 
 		 452 aa  110  8.000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0297  beta-lactamase  43.54 
 
 		 417 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.834567  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3197  beta-lactamase  42.86 
 
 		 417 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.27684  normal  0.21357 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2288  beta-lactamase  40.65 
 
 		 424 aa  108  3e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.637416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1601  beta-lactamase  38.18 
 
 		 444 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2361  beta-lactamase  48.12 
 
 		 401 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.597204  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2408  beta-lactamase  48.12 
 
 		 401 aa  108  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.234051  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3517  beta-lactamase  37.06 
 
 		 447 aa  107  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11398  hypothetical protein  42.86 
 
 		 401 aa  107  7.000000000000001e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2298  beta-lactamase  39.61 
 
 		 440 aa  106  1e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.322057  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5097  beta-lactamase family penicillin binding protein  38.41 
 
 		 411 aa  105  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0812  beta-lactamase  42.18 
 
 		 408 aa  105  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.623448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5786  beta-lactamase family protein  41.56 
 
 		 420 aa  105  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0584533 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2402  beta-lactamase  47.37 
 
 		 401 aa  105  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.475057 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3702  beta-lactamase  39.22 
 
 		 430 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0538  beta-lactamase  36.25 
 
 		 433 aa  104  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2371  beta-lactamase  50 
 
 		 370 aa  105  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2265  beta-lactamase  34.44 
 
 		 407 aa  103  8e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.120111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5391  putative beta-lactamase  39.86 
 
 		 414 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4649  Beta-lactamase  43.45 
 
 		 418 aa  102  2e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3205  beta-lactamase  33.77 
 
 		 407 aa  102  2e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3743  beta-lactamase  40.26 
 
 		 420 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4820  beta-lactamase  40.26 
 
 		 420 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.85681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1690  beta-lactamase  37.84 
 
 		 426 aa  100  6e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1745  beta-lactamase  40 
 
 		 454 aa  99.4  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0870  beta-lactamase  41.29 
 
 		 410 aa  99.4  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.487192  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1762  beta-lactamase  37.25 
 
 		 431 aa  99.8  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.178293  normal  0.700473 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2694  beta-lactamase  40.41 
 
 		 453 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.493154  normal  0.955083 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3006  beta-lactamase  38.24 
 
 		 423 aa  98.2  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3477  beta-lactamase  35.48 
 
 		 409 aa  98.2  4e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.295738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3704  beta-lactamase  33.77 
 
 		 407 aa  97.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.136974  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0589  beta-lactamase  38.51 
 
 		 438 aa  96.7  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1560  beta-lactamase  35.67 
 
 		 412 aa  96.7  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1881  beta-lactamase  36.18 
 
 		 613 aa  94  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.234575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2189  beta-lactamase  38.93 
 
 		 402 aa  93.2  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.13371  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5491  beta-lactamase  42.07 
 
 		 407 aa  92.8  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.442272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3069  beta-lactamase  38.36 
 
 		 400 aa  92.8  2e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.489639  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3750  beta-lactamase  40.77 
 
 		 397 aa  92.4  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.697979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0570  beta-lactamase  39.19 
 
 		 438 aa  92.4  2e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3485  beta-lactamase  37.24 
 
 		 440 aa  90.9  6e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.807296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1214  beta-lactamase  35.29 
 
 		 435 aa  90.5  8e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2265  twin-arginine translocation pathway signal  44.76 
 
 		 428 aa  90.5  8e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5281  beta-lactamase  40.74 
 
 		 408 aa  90.1  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0166031 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0011  beta-lactamase  33.33 
 
 		 427 aa  89.7  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000120746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3564  beta-lactamase  40 
 
 		 397 aa  90.1  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3853  Beta-lactamase  36.77 
 
 		 415 aa  89.4  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1252  beta-lactamase  39.55 
 
 		 389 aa  88.6  3e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0579433 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2708  Beta-lactamase  34.44 
 
 		 436 aa  87.8  5e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.259785  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1692  Beta-lactamase  39.46 
 
 		 414 aa  87.4  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0446405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2152  beta-lactamase  44.54 
 
 		 409 aa  86.7  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129133 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3034  beta-lactamase  38.93 
 
 		 413 aa  85.5  2e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396527  normal  0.941046 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1105  beta-lactamase  40.32 
 
 		 389 aa  85.9  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2750  beta-lactamase  36.03 
 
 		 437 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.106005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5094  beta-lactamase  40.15 
 
 		 254 aa  84.3  5e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.565377  normal  0.769745 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2637  beta-lactamase  39.55 
 
 		 398 aa  84.3  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3562  beta-lactamase  42.75 
 
 		 394 aa  84  7e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.451729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0019  beta-lactamase  41.04 
 
 		 416 aa  83.6  9e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3149  beta-lactamase  35.34 
 
 		 430 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360137  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0708  beta-lactamase  41.41 
 
 		 396 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0410275  normal  0.41428 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0394  putative 1,4-butanediol diacrylate esterase  39.71 
 
 		 397 aa  82.8  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34700  putative beta lactamase  37.5 
 
 		 391 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00182422  normal  0.248771 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1108  beta-lactamase  41.41 
 
 		 396 aa  82  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35880  Beta-lactamase-like protein  36.15 
 
 		 396 aa  81.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.184718  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1979  beta-lactamase  42.98 
 
 		 398 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.663801  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2589  beta-lactamase  42.98 
 
 		 398 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.224311  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0579  beta-lactamase  37.6 
 
 		 395 aa  80.9  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.521189  normal  0.351765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3549  beta-lactamase  37.68 
 
 		 400 aa  80.5  0.000000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4045  beta-lactamase  38.46 
 
 		 393 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3476  beta-lactamase  38.17 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1860  putative esterase  43.52 
 
 		 399 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1896  beta-lactamase  31.58 
 
 		 425 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.227365  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0340  esterase, putative  38.17 
 
 		 398 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2474  putative esterase  38.17 
 
 		 398 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.506613  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0087  putative esterase  38.17 
 
 		 398 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.490998  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0639  putative esterase  38.17 
 
 		 398 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.74574  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>