198 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2719 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_2715  VCBS  82.75 
 
 		 3026 aa  1187    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2719  hemolysin-type calcium-binding protein  100 
 
 		 796 aa  1606    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2717  hypothetical protein  45.93 
 
 		 498 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00657711  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3089  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  29.96 
 
 		 2689 aa  92.4  3e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.470754 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0249  putative calcium binding hemolysin protein  28.05 
 
 		 1499 aa  71.6  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.74922  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0986  Hemolysin-type calcium binding domain protein  30.1 
 
 		 4798 aa  64.3  0.000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0124  hemolysin-type calcium-binding region  28.57 
 
 		 515 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2370  Ig family protein  29.79 
 
 		 2954 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0246  putative calcium binding hemolysin protein  28.53 
 
 		 1156 aa  62  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.383795  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2550  putative outer membrane adhesin like protein  27.38 
 
 		 3598 aa  61.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2298  hemolysin-type calcium binding protein  28.41 
 
 		 1480 aa  58.5  0.0000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.880239  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2577  hemolysin-type calcium-binding region  25.59 
 
 		 1383 aa  58.9  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0100249  normal  0.0162919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0168  surface adhesion protein, putative  55.1 
 
 		 8682 aa  58.5  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.810778 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2124  hemolysin-type calcium-binding region  28.84 
 
 		 946 aa  58.5  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0188  hypothetical protein  55.1 
 
 		 9030 aa  58.2  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0220008 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2501  Cadherin  29.52 
 
 		 942 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.390828  normal  0.873412 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0514  RTX toxins and related Ca2+-binding protein  28.48 
 
 		 1279 aa  57  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2204  peptidase M23  38.78 
 
 		 999 aa  56.2  0.000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0186  hypothetical protein  52.94 
 
 		 6753 aa  56.2  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.306412 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5060  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  48.48 
 
 		 5962 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.943676 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0804  hemolysin-type calcium-binding region  39.13 
 
 		 2885 aa  55.5  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2160  Hemolysin-type calcium-binding region  29.23 
 
 		 3954 aa  55.5  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5287  serralysin  28.68 
 
 		 648 aa  55.1  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3695  proprotein convertase P  42.27 
 
 		 2911 aa  55.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.523637 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2786  hemolysin-type calcium-binding region  28.18 
 
 		 518 aa  54.7  0.000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.248121  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1441  Ig family protein  25.45 
 
 		 2245 aa  54.7  0.000007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.195412  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0314  putative outer membrane adhesin like proteiin  37.76 
 
 		 1553 aa  54.3  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0526571  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3265  sulfatase  35.85 
 
 		 770 aa  54.3  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4162  outer membrane adhesin like proteiin  28.5 
 
 		 4687 aa  54.3  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0327  hemolysin-type calcium binding protein  43.37 
 
 		 1814 aa  53.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0391395  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0805  glycerophosphoryl diester phosphodiesterase  40.38 
 
 		 1236 aa  52.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3872  hemolysin-type calcium-binding region  43.37 
 
 		 1895 aa  52.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.308786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3265  Ig family protein  41.86 
 
 		 3209 aa  52  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.594871  decreased coverage  0.00759247 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0133  von Willebrand factor, type A  36.84 
 
 		 5218 aa  52  0.00004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.809343 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1122  outer membrane adhesin like proteiin  41.58 
 
 		 2784 aa  52  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2205  Hemolysin-type calcium-binding region  27.52 
 
 		 928 aa  52  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.99392 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7343  Hemolysin-type calcium-binding region  41.46 
 
 		 615 aa  52  0.00004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3871  RTX toxins and related Ca2+-binding protein-like protein  44.3 
 
 		 1164 aa  52  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.318671  normal  1 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4242  hemolysin-type calcium-binding protein  28.48 
 
 		 1544 aa  51.6  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0791  heme peroxidase  53.7 
 
 		 2950 aa  51.6  0.00006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1877  Hemolysin-type calcium-binding region  29.23 
 
 		 4800 aa  51.6  0.00006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6816  Hemolysin-type calcium-binding region  40.26 
 
 		 526 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3074  hemolysin-type calcium-binding region:haemolysin-type calcium binding related  27.36 
 
 		 855 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0479509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0722  hemolysin-type calcium-binding region  52.08 
 
 		 851 aa  51.2  0.00008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3615  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  44.83 
 
 		 868 aa  50.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.705484  normal  0.0425486 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0008  Hemolysin-type calcium-binding region  54.35 
 
 		 2336 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0050  hemolysin-type calcium-binding region  40.24 
 
 		 2296 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.133604 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0380  VCBS  27.39 
 
 		 1586 aa  49.7  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.101859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1919  hypothetical protein  41.56 
 
 		 1526 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.369591  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0803  5'-nucleotidase  39.42 
 
 		 2667 aa  50.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1663  Hemolysin-type calcium-binding region  56.52 
 
 		 824 aa  50.1  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.157908  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2425  hypothetical protein  27.99 
 
 		 559 aa  50.1  0.0002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.306646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3642  putative outer membrane adhesin like protein  44.12 
 
 		 4791 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1905  putative outer membrane adhesin like proteiin  43.42 
 
 		 1963 aa  49.7  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.849124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4004  putative outer membrane adhesin like proteiin  44.12 
 
 		 2239 aa  50.1  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.328168  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3154  heme peroxidase  43.02 
 
 		 3619 aa  49.3  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.468866 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001580  rTX toxin putative  41.03 
 
 		 2743 aa  50.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2110  Serralysin  48.89 
 
 		 480 aa  48.9  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.67403  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06448  hemolysin A  25.83 
 
 		 1112 aa  48.9  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3216  hypothetical protein  26.07 
 
 		 595 aa  49.3  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00990527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1566  outer membrane adhesin like proteiin  44.59 
 
 		 1712 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.6196  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1564  5'-Nucleotidase domain protein  43.24 
 
 		 2775 aa  49.3  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  36.46 
 
 		 525 aa  49.3  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1553  Serralysin  53.33 
 
 		 476 aa  49.3  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4565  hemolysin-type calcium-binding region  37.86 
 
 		 387 aa  49.3  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.520328  normal  0.522149 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2561  heme peroxidase  41.86 
 
 		 3619 aa  48.5  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.59491 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1696  metallophosphoesterase  27.16 
 
 		 2105 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4929  hemolysin-type calcium-binding region  50.79 
 
 		 2097 aa  48.5  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1215  type 1 secretion target domain protein  47.17 
 
 		 2542 aa  48.5  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0488  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  42.39 
 
 		 577 aa  48.5  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.718847  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3523  hemolysin-type calcium-binding region  29.1 
 
 		 462 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4754  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  44.16 
 
 		 3427 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0122  hemolysin-type calcium-binding region  31.62 
 
 		 534 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.589398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1936  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.46 
 
 		 1016 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1066  hemolysin-type calcium-binding protein  44.05 
 
 		 950 aa  48.5  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0187032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4098  outer membrane adhesin like proteiin  47.06 
 
 		 6662 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3982  putative outer membrane adhesin like proteiin  47.06 
 
 		 6683 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14361  hypothetical protein  33.33 
 
 		 4723 aa  48.5  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3905  outer membrane adhesin like proteiin  47.06 
 
 		 6779 aa  48.5  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3148  hemolysin-type calcium-binding region  40 
 
 		 493 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0237525  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3643  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  41.03 
 
 		 1180 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4728  endonuclease/exonuclease/phosphatase  46 
 
 		 2346 aa  48.1  0.0006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2246  VCBS  27.73 
 
 		 5769 aa  48.1  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3681  hemolysin-type calcium-binding protein  50 
 
 		 1462 aa  48.1  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5158  hemolysin-type calcium-binding region  26.71 
 
 		 1534 aa  48.1  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.316127  normal  0.475522 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1874  Hemolysin-type calcium-binding region  26.84 
 
 		 4334 aa  48.1  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4380  hemolysin-type calcium-binding region  36.84 
 
 		 448 aa  48.1  0.0006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.081589  normal  0.243614 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0158  Hemolysin-type calcium-binding protein  28.79 
 
 		 1145 aa  48.1  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  38.67 
 
 		 1019 aa  48.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0583  putative Ig  36.84 
 
 		 1055 aa  48.1  0.0007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2591  cadherin  42.37 
 
 		 2145 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.213456 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4191  hemolysin-type calcium-binding region  35.29 
 
 		 982 aa  47.8  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.735923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0018  RTX C- domain protein  47.92 
 
 		 998 aa  48.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1633  hypothetical protein  37.93 
 
 		 318 aa  47.8  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0477  outer membrane adhesin like proteiin  43.24 
 
 		 16322 aa  47.8  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0360  hemolysin-type calcium-binding region  32.67 
 
 		 243 aa  47.8  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.624774 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0793  hemolysin-type calcium-binding region  44.3 
 
 		 795 aa  47.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.873812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0263  hypothetical protein  37.76 
 
 		 742 aa  47.8  0.0009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0632  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  25.96 
 
 		 1415 aa  47.8  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3060  von Willebrand factor type A  55.56 
 
 		 4678 aa  47.8  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>