135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_0845 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 528 aa  1073    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  84.76 
 
 		 526 aa  935    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  86.67 
 
 		 528 aa  955    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  88.02 
 
 		 530 aa  973    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  58.97 
 
 		 528 aa  625  1e-178  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  54.2 
 
 		 516 aa  556  1e-157  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  49.51 
 
 		 530 aa  496  1e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  44.64 
 
 		 531 aa  457  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  35.66 
 
 		 621 aa  313  5.999999999999999e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  36.71 
 
 		 663 aa  311  1e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  34.06 
 
 		 600 aa  309  9e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  36.02 
 
 		 622 aa  304  2.0000000000000002e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  34.26 
 
 		 600 aa  299  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  35.89 
 
 		 600 aa  298  2e-79  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  34.65 
 
 		 600 aa  294  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  32.38 
 
 		 606 aa  287  2.9999999999999996e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  33.2 
 
 		 613 aa  281  3e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  30.67 
 
 		 682 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  30.44 
 
 		 697 aa  266  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  30.69 
 
 		 604 aa  260  4e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  30.14 
 
 		 689 aa  258  2e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  30.14 
 
 		 697 aa  257  4e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  31.4 
 
 		 672 aa  225  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  37.75 
 
 		 626 aa  193  7e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.94 
 
 		 824 aa  184  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  35.58 
 
 		 825 aa  183  6e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  35.02 
 
 		 807 aa  178  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  34.44 
 
 		 818 aa  172  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  36.4 
 
 		 807 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  33.48 
 
 		 664 aa  123  9e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  32.61 
 
 		 664 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  32.61 
 
 		 664 aa  120  9e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  32.22 
 
 		 662 aa  117  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  31.44 
 
 		 666 aa  114  6e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.91 
 
 		 589 aa  52  0.00003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 1003 aa  51.2  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  36.14 
 
 		 418 aa  51.2  0.00004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  45 
 
 		 420 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.83 
 
 		 524 aa  48.9  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  30.57 
 
 		 882 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  27.12 
 
 		 655 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 597 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  35.56 
 
 		 547 aa  48.9  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 436 aa  48.5  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0629  DNA mismatch repair protein MutL  29.88 
 
 		 767 aa  47.8  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5188  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 482 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000262234 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1030  DNA mismatch repair protein MutL  27.72 
 
 		 560 aa  47.8  0.0005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4172  DNA mismatch repair protein  25.97 
 
 		 614 aa  47.8  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  25.7 
 
 		 635 aa  46.2  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 595 aa  46.6  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  23.84 
 
 		 644 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  23.84 
 
 		 644 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.71 
 
 		 488 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  30 
 
 		 648 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.86 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3282  DNA mismatch repair protein  23.84 
 
 		 641 aa  46.2  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645074  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.49 
 
 		 718 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  29.23 
 
 		 876 aa  46.6  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7544  Signal transduction histidine kinase-like protein  30.59 
 
 		 1051 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.03 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 		 482 aa  46.6  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  31.03 
 
 		 518 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  32.74 
 
 		 537 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  29.44 
 
 		 616 aa  45.4  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  28 
 
 		 633 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0556  DNA mismatch repair protein  25 
 
 		 638 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000137773  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  26.6 
 
 		 551 aa  45.4  0.002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  28 
 
 		 633 aa  45.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3769  DNA mismatch repair protein  25 
 
 		 630 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00256823  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  36.84 
 
 		 540 aa  45.8  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2281  histidine kinase  38.37 
 
 		 558 aa  45.4  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.278764 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3895  DNA mismatch repair protein  25 
 
 		 638 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.329435  normal  0.756046 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3712  DNA mismatch repair protein  25 
 
 		 637 aa  45.8  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3382  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 		 470 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3207  DNA mismatch repair protein  25.58 
 
 		 665 aa  45.1  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000351816  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3313  DNA mismatch repair protein  24.42 
 
 		 619 aa  45.1  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 722 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  32.22 
 
 		 628 aa  45.1  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 		 379 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2947  sensor histidine kinase  41.38 
 
 		 475 aa  44.7  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  28 
 
 		 632 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  29.65 
 
 		 630 aa  44.7  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3027  DNA mismatch repair protein  26.59 
 
 		 650 aa  44.7  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0173835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  28 
 
 		 633 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 646 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 625 aa  45.1  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 		 615 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  29.67 
 
 		 615 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 		 613 aa  44.3  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2626  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 406 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.640199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  25.23 
 
 		 635 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3365  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.38 
 
 		 733 aa  44.3  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  25.23 
 
 		 635 aa  44.3  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  25.23 
 
 		 635 aa  44.3  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 		 615 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 		 615 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  29.67 
 
 		 615 aa  44.3  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0917  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 494 aa  44.3  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000856467  hitchhiker  9.75464e-20 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3616  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  31.76 
 
 		 489 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>