39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0315 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  87.24 
 
 		 664 aa  1176    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  86.8 
 
 		 664 aa  1167    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  70.84 
 
 		 662 aa  944    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 666 aa  1359    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  86.34 
 
 		 664 aa  1179    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  41.7 
 
 		 621 aa  208  3e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  40.77 
 
 		 663 aa  207  7e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  41.5 
 
 		 613 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  37.68 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  39.03 
 
 		 600 aa  201  3e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  38.74 
 
 		 807 aa  200  7e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  39.22 
 
 		 622 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  40.14 
 
 		 825 aa  199  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  41.35 
 
 		 600 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  39.07 
 
 		 824 aa  195  2e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  37.96 
 
 		 807 aa  190  5.999999999999999e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  37.55 
 
 		 604 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  40.37 
 
 		 600 aa  189  2e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  38.57 
 
 		 818 aa  187  5e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  36.5 
 
 		 697 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  37.17 
 
 		 689 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  37.41 
 
 		 697 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  38.13 
 
 		 606 aa  177  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  33.08 
 
 		 531 aa  141  3.9999999999999997e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  35.6 
 
 		 528 aa  135  3e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  32.58 
 
 		 530 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  33.64 
 
 		 626 aa  128  4.0000000000000003e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  31.89 
 
 		 516 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  31.44 
 
 		 528 aa  114  7.000000000000001e-24  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  31.76 
 
 		 528 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  31.17 
 
 		 526 aa  112  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  30.96 
 
 		 530 aa  110  9.000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  30.65 
 
 		 672 aa  99  3e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  28.06 
 
 		 682 aa  84  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  30 
 
 		 882 aa  47  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0908  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.7 
 
 		 1267 aa  45.8  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.142245  normal  0.539943 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.92 
 
 		 704 aa  45.8  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.352611  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  28.91 
 
 		 738 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  28.7 
 
 		 881 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>