39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_0130 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  68.08 
 
 		 824 aa  1105    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  68.16 
 
 		 825 aa  1119    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  68 
 
 		 807 aa  1115    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 807 aa  1638    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  67.11 
 
 		 818 aa  1085    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  55.64 
 
 		 622 aa  324  4e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  56.68 
 
 		 613 aa  323  8e-87  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  54.55 
 
 		 621 aa  318  2e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  55.84 
 
 		 600 aa  312  1e-83  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  54.18 
 
 		 663 aa  311  2.9999999999999997e-83  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  52.14 
 
 		 600 aa  304  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  52 
 
 		 600 aa  301  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  53.48 
 
 		 600 aa  299  1e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  54.38 
 
 		 606 aa  292  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  48.67 
 
 		 697 aa  290  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  31.09 
 
 		 664 aa  290  9e-77  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  30.52 
 
 		 664 aa  281  5e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  46.18 
 
 		 697 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  46.18 
 
 		 689 aa  280  8e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  29.53 
 
 		 666 aa  278  2e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  46.13 
 
 		 604 aa  277  6e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  29.59 
 
 		 664 aa  273  8.000000000000001e-72  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  36.7 
 
 		 662 aa  190  9e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  37.5 
 
 		 531 aa  174  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  36.4 
 
 		 528 aa  169  2e-40  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  36.57 
 
 		 526 aa  169  2e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  35.82 
 
 		 530 aa  169  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.31 
 
 		 530 aa  167  6.9999999999999995e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  36.26 
 
 		 528 aa  165  3e-39  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  34.56 
 
 		 528 aa  165  3e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  35.94 
 
 		 516 aa  159  2e-37  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  36.67 
 
 		 626 aa  144  7e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  29.86 
 
 		 682 aa  105  4e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  29.78 
 
 		 672 aa  93.6  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1497  ATPase domain-containing protein  28.75 
 
 		 945 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0028368  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  29.17 
 
 		 460 aa  47.8  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  30.1 
 
 		 882 aa  45.8  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 335 aa  45.4  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  31.11 
 
 		 881 aa  44.3  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>