36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_1203 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  74.07 
 
 		 621 aa  972    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  59.93 
 
 		 613 aa  775    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 622 aa  1273    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  51.19 
 
 		 663 aa  619  1e-176  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  50.43 
 
 		 606 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  48.38 
 
 		 600 aa  557  1e-157  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  47.35 
 
 		 600 aa  551  1e-155  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  47.35 
 
 		 600 aa  548  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  47.52 
 
 		 600 aa  535  1e-151  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  44.3 
 
 		 697 aa  453  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  42.42 
 
 		 697 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  42.11 
 
 		 604 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  42.07 
 
 		 689 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  60 
 
 		 825 aa  342  2e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  58.7 
 
 		 824 aa  334  3e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  58.76 
 
 		 818 aa  332  2e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  55.64 
 
 		 807 aa  323  5e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  53.85 
 
 		 807 aa  323  8e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  34.18 
 
 		 531 aa  320  3.9999999999999996e-86  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  37.13 
 
 		 528 aa  306  7e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  36.02 
 
 		 528 aa  304  3.0000000000000004e-81  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  34.86 
 
 		 516 aa  300  4e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  35.96 
 
 		 526 aa  298  2e-79  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  34.85 
 
 		 530 aa  296  8e-79  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  35.2 
 
 		 528 aa  295  2e-78  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  33.74 
 
 		 530 aa  293  6e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  27.77 
 
 		 682 aa  210  7e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  39.22 
 
 		 666 aa  200  7.999999999999999e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  38.03 
 
 		 664 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  36.75 
 
 		 664 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  36.75 
 
 		 662 aa  197  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  37.32 
 
 		 664 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  27.57 
 
 		 672 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  34.05 
 
 		 626 aa  142  3e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  31.93 
 
 		 460 aa  47.4  0.0009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  37.84 
 
 		 882 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>