59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2284 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  85.49 
 
 		 824 aa  1412    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  100 
 
 		 825 aa  1679    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  68.16 
 
 		 807 aa  1105    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  70.5 
 
 		 818 aa  1161    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  65.83 
 
 		 807 aa  1115    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  55.62 
 
 		 621 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  60 
 
 		 622 aa  342  2e-92  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  58.24 
 
 		 613 aa  333  7.000000000000001e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  54.98 
 
 		 600 aa  314  3.9999999999999997e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  51.64 
 
 		 600 aa  311  2.9999999999999997e-83  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  55.56 
 
 		 606 aa  310  5e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  52.21 
 
 		 600 aa  309  1.0000000000000001e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  49.22 
 
 		 663 aa  306  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  52.96 
 
 		 600 aa  304  4.0000000000000003e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  46.5 
 
 		 697 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  48.33 
 
 		 697 aa  287  5e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  48.33 
 
 		 689 aa  287  7e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  49.12 
 
 		 604 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  29.81 
 
 		 666 aa  277  6e-73  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  40.89 
 
 		 664 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  42.41 
 
 		 664 aa  198  3e-49  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  40.82 
 
 		 664 aa  197  7e-49  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  38.91 
 
 		 531 aa  192  2.9999999999999997e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  37.1 
 
 		 662 aa  191  5e-47  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  35.58 
 
 		 528 aa  184  8.000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  35.58 
 
 		 530 aa  183  1e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  35.27 
 
 		 530 aa  181  7e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  33.83 
 
 		 528 aa  178  4e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  35.61 
 
 		 516 aa  176  9.999999999999999e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  33.33 
 
 		 526 aa  176  1.9999999999999998e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  35.34 
 
 		 528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  34.14 
 
 		 626 aa  145  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  28 
 
 		 672 aa  107  1e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  30.21 
 
 		 682 aa  102  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 454 aa  54.3  0.000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  32.04 
 
 		 882 aa  53.9  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 379 aa  48.9  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 454 aa  47.8  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  32.47 
 
 		 540 aa  47.8  0.001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  33.04 
 
 		 394 aa  46.2  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.16 
 
 		 379 aa  46.6  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  29.01 
 
 		 460 aa  46.6  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  31.82 
 
 		 378 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  26.12 
 
 		 356 aa  46.2  0.003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2733  ATP-binding region ATPase domain protein  42.86 
 
 		 355 aa  45.4  0.004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2160  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 377 aa  45.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0672592 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  35.23 
 
 		 371 aa  45.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 335 aa  45.4  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 451 aa  44.7  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1565  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 543 aa  45.1  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.379725  normal  0.789808 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1667  sensor histidine kinase  31.68 
 
 		 652 aa  45.1  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.976342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.21 
 
 		 451 aa  45.1  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 443 aa  45.1  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  27.97 
 
 		 461 aa  44.7  0.007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  34.71 
 
 		 649 aa  44.7  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.78 
 
 		 444 aa  44.7  0.008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  37.93 
 
 		 395 aa  44.7  0.008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 449 aa  44.3  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 456 aa  44.3  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>