More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_1521 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_0433  DNA mismatch repair protein MutL  72.34 
 
 
544 aa  758    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.397658  normal  0.543427 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
540 aa  1057    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1538  DNA mismatch repair protein MutL  48.61 
 
 
549 aa  425  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.186199  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  33.79 
 
 
586 aa  294  4e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  38.14 
 
 
560 aa  289  8e-77  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  35.34 
 
 
566 aa  278  2e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  34.74 
 
 
566 aa  273  5.000000000000001e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  34.39 
 
 
566 aa  271  2e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  35.05 
 
 
565 aa  270  4e-71  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2227  MutL dimerisation  37.63 
 
 
584 aa  259  1e-67  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.000451621  normal  0.617767 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1478  DNA mismatch repair protein MutL  35 
 
 
557 aa  258  2e-67  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.064699  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  30.92 
 
 
559 aa  257  4e-67  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  34.49 
 
 
608 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1168  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 
588 aa  254  3e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.985109  normal  0.444607 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  32.33 
 
 
599 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  33.83 
 
 
605 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  35.85 
 
 
582 aa  251  2e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  34.16 
 
 
607 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  34.32 
 
 
607 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  30.95 
 
 
603 aa  246  8e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  32.23 
 
 
606 aa  244  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  35.39 
 
 
601 aa  243  7.999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1331  DNA mismatch repair protein MutL  33.21 
 
 
579 aa  242  1e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  33.85 
 
 
585 aa  241  2e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  30.83 
 
 
602 aa  241  2.9999999999999997e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  31.97 
 
 
589 aa  239  1e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  33.1 
 
 
575 aa  239  1e-61  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  32.15 
 
 
622 aa  238  2e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0293  DNA mismatch repair protein MutL  37.38 
 
 
532 aa  237  4e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 
574 aa  237  5.0000000000000005e-61  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0977  DNA mismatch repair ATPase  30.94 
 
 
584 aa  234  4.0000000000000004e-60  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0710055  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  34.25 
 
 
632 aa  228  3e-58  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  34.67 
 
 
598 aa  227  5.0000000000000005e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  33.73 
 
 
582 aa  226  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  28.2 
 
 
572 aa  225  1e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  33.06 
 
 
611 aa  225  2e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  33.72 
 
 
616 aa  224  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  33.94 
 
 
612 aa  225  2e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  29.78 
 
 
588 aa  223  9e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  33.39 
 
 
603 aa  220  6e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0769  DNA mismatch repair protein MutL  30.67 
 
 
551 aa  219  7e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  32.39 
 
 
594 aa  219  7e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  31.47 
 
 
595 aa  219  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  31.47 
 
 
595 aa  219  1e-55  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  31.9 
 
 
633 aa  218  2.9999999999999998e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3702  DNA mismatch repair protein  33.45 
 
 
575 aa  213  7e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  29.87 
 
 
612 aa  211  3e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0923  DNA mismatch repair protein MutL  32.35 
 
 
516 aa  211  3e-53  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  32.45 
 
 
606 aa  211  3e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1030  DNA mismatch repair protein MutL  33.51 
 
 
560 aa  211  4e-53  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.110896  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  30.46 
 
 
605 aa  210  6e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  31.29 
 
 
600 aa  210  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1499  DNA mismatch repair protein MutL  25.86 
 
 
589 aa  210  7e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0901  DNA mismatch repair protein MutL  31.72 
 
 
516 aa  209  8e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  31.73 
 
 
602 aa  209  9e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2630  DNA mismatch repair protein MutL  31.11 
 
 
565 aa  207  4e-52  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1780  DNA mismatch repair protein  33.95 
 
 
541 aa  206  8e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.644143 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  32.57 
 
 
605 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  32.12 
 
 
610 aa  204  5e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0856  DNA mismatch repair protein  30.62 
 
 
563 aa  201  3.9999999999999996e-50  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.127001 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  31.11 
 
 
600 aa  200  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0215  DNA mismatch repair protein MutL  29.45 
 
 
608 aa  197  3e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal  0.137951 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  32.01 
 
 
621 aa  197  5.000000000000001e-49  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  39.32 
 
 
610 aa  196  1e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  31.68 
 
 
632 aa  196  1e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  30.82 
 
 
597 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1937  DNA mismatch repair protein  31.52 
 
 
561 aa  194  4e-48  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  40.55 
 
 
621 aa  194  4e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  28.62 
 
 
611 aa  194  5e-48  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1964  DNA mismatch repair protein  31.52 
 
 
561 aa  193  5e-48  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.176062 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  31.56 
 
 
608 aa  193  6e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  31.03 
 
 
635 aa  193  7e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  40.24 
 
 
619 aa  192  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  36.08 
 
 
628 aa  192  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  31.46 
 
 
595 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  30 
 
 
615 aa  191  2e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  37.35 
 
 
615 aa  192  2e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  34.09 
 
 
647 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  29.81 
 
 
566 aa  191  4e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  30.15 
 
 
597 aa  191  4e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  30.81 
 
 
603 aa  190  5.999999999999999e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  36.7 
 
 
656 aa  190  5.999999999999999e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  40.45 
 
 
620 aa  188  2e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  39.94 
 
 
635 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  40.12 
 
 
625 aa  188  2e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  34.74 
 
 
659 aa  187  3e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  31 
 
 
603 aa  187  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2732  DNA mismatch repair protein MutL  37.14 
 
 
730 aa  187  3e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0867295  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  34.27 
 
 
645 aa  187  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1494  DNA mismatch repair protein MutL  35.05 
 
 
692 aa  187  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  39.02 
 
 
605 aa  187  5e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  30.38 
 
 
599 aa  186  8e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  32.8 
 
 
643 aa  186  8e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  40.37 
 
 
636 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  39.94 
 
 
647 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  32.46 
 
 
604 aa  184  3e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  38.41 
 
 
605 aa  183  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  34.47 
 
 
669 aa  183  6e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  37.23 
 
 
670 aa  183  8.000000000000001e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0376  DNA mismatch repair protein MutL  37.76 
 
 
709 aa  182  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.13305  normal  0.32452 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>