66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0666 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 516 aa  1043    Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  54.2 
 
 		 528 aa  556  1e-157  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  52.4 
 
 		 530 aa  543  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  52.8 
 
 		 526 aa  545  1e-153  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  52.8 
 
 		 528 aa  538  9.999999999999999e-153  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  51.39 
 
 		 528 aa  513  1e-144  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  44.53 
 
 		 531 aa  455  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  46.36 
 
 		 530 aa  439  9.999999999999999e-123  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  34.87 
 
 		 600 aa  315  1.9999999999999998e-84  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  35.36 
 
 		 600 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  37.65 
 
 		 663 aa  308  2.0000000000000002e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  37.79 
 
 		 600 aa  306  4.0000000000000004e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  32.7 
 
 		 621 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  34.86 
 
 		 622 aa  300  3e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  34.17 
 
 		 606 aa  300  5e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  34.35 
 
 		 613 aa  298  1e-79  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  33.2 
 
 		 600 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  31.01 
 
 		 697 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  31.87 
 
 		 604 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  31.87 
 
 		 697 aa  256  9e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  31.51 
 
 		 689 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  30.16 
 
 		 682 aa  250  5e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  33.1 
 
 		 672 aa  247  3e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  43.5 
 
 		 626 aa  194  4e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  35.61 
 
 		 825 aa  176  7e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  36.43 
 
 		 818 aa  172  1e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  35.16 
 
 		 824 aa  171  3e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  34.66 
 
 		 807 aa  168  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  35.94 
 
 		 807 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  36.92 
 
 		 664 aa  140  4.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  35.66 
 
 		 664 aa  140  7.999999999999999e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  35.38 
 
 		 664 aa  137  5e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  31.89 
 
 		 666 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  32.34 
 
 		 662 aa  117  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 		 420 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1236  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 386 aa  49.7  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.493129  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0478  histidine kinase  34.78 
 
 		 555 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.560967  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4530  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 386 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 		 597 aa  47  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 527 aa  47  0.0008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 436 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  33.71 
 
 		 1152 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 597 aa  46.2  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05645  two-component sensor histidine kinase transcription regulator protein  30.33 
 
 		 512 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  32 
 
 		 646 aa  45.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 524 aa  45.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 419 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  26.45 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0817  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.59 
 
 		 451 aa  45.4  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.45 
 
 		 518 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 444 aa  45.4  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0726  response regulator  33.33 
 
 		 651 aa  44.7  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000761968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 343 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 718 aa  44.7  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 722 aa  44.3  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.14 
 
 		 662 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0917  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.51 
 
 		 494 aa  43.9  0.008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000856467  hitchhiker  9.75464e-20 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04720  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 331 aa  43.5  0.008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0135462  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11671  adaptive-response sensory kinase  28.74 
 
 		 372 aa  43.5  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4086  histidine kinase  34.41 
 
 		 412 aa  43.5  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.3591 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  33.33 
 
 		 418 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0195  sensory box histidine kinase  27.78 
 
 		 791 aa  43.5  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00184929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0951  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.97 
 
 		 452 aa  43.5  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 482 aa  43.5  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0198  sensory box histidine kinase  27.78 
 
 		 791 aa  43.5  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00155091  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.25 
 
 		 1039 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000191257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>