89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cmaq_1219 on replicon NC_009954
Organism: Caldivirga maquilingensis IC-167



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 528 aa  1080    Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  58.97 
 
 		 528 aa  625  1e-178  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  58.02 
 
 		 526 aa  623  1e-177  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  57.73 
 
 		 530 aa  614  9.999999999999999e-175  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  57.57 
 
 		 528 aa  608  1e-173  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  51.39 
 
 		 516 aa  513  1e-144  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  48.13 
 
 		 530 aa  471  1.0000000000000001e-131  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  44.09 
 
 		 531 aa  456  1e-127  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  37.13 
 
 		 622 aa  306  6e-82  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  35.71 
 
 		 613 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  34.51 
 
 		 600 aa  304  3.0000000000000004e-81  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  37.08 
 
 		 621 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  35.1 
 
 		 600 aa  299  7e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  36.12 
 
 		 663 aa  293  5e-78  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  35.65 
 
 		 600 aa  293  7e-78  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  36.68 
 
 		 606 aa  288  1e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  36.24 
 
 		 600 aa  286  8e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  29.54 
 
 		 697 aa  272  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  29.89 
 
 		 604 aa  264  3e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  29.89 
 
 		 697 aa  262  8.999999999999999e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  29.7 
 
 		 689 aa  261  2e-68  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  29.55 
 
 		 682 aa  254  4.0000000000000004e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  29.72 
 
 		 672 aa  249  1e-64  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  41.11 
 
 		 626 aa  182  1e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  35.34 
 
 		 825 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  36.26 
 
 		 818 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  33.82 
 
 		 807 aa  172  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.21 
 
 		 824 aa  169  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  36.26 
 
 		 807 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  38.43 
 
 		 662 aa  144  5e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  35.6 
 
 		 666 aa  134  3e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  36.4 
 
 		 664 aa  134  5e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  35.2 
 
 		 664 aa  131  3e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  34.8 
 
 		 664 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.98 
 
 		 597 aa  51.2  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 488 aa  50.4  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 662 aa  50.4  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.35 
 
 		 597 aa  50.4  0.00009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0244  two component system histidine kinase  29.6 
 
 		 657 aa  50.1  0.00009  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1954  PAS/histidine kinase/ATPase domain-containing protein  27.5 
 
 		 657 aa  49.7  0.0001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1570  Signal transduction histidine kinase-like  29.85 
 
 		 666 aa  49.3  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.733845  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  21.33 
 
 		 790 aa  49.3  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0543  histidine kinase  29.57 
 
 		 288 aa  48.5  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0596277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.81 
 
 		 1003 aa  48.5  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  31.2 
 
 		 876 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.6 
 
 		 385 aa  47  0.0009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  36.36 
 
 		 336 aa  47  0.0009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  41.43 
 
 		 591 aa  46.2  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0198  sensory box histidine kinase  30.48 
 
 		 791 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00155091  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0195  sensory box histidine kinase  30.19 
 
 		 791 aa  47  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00184929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1713  histidine kinase  30.08 
 
 		 464 aa  46.6  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.529234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 		 453 aa  47  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2730  histidine kinase  27.35 
 
 		 385 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.484576 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2225  histidine kinase  28.23 
 
 		 845 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0086849  normal  0.197777 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2163  histidine kinase  28.23 
 
 		 845 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0917  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.97 
 
 		 494 aa  45.8  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000856467  hitchhiker  9.75464e-20 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  32.46 
 
 		 540 aa  45.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 489 aa  45.1  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  32.41 
 
 		 584 aa  44.7  0.004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.09 
 
 		 683 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  24.43 
 
 		 547 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2082  histidine kinase  28.04 
 
 		 714 aa  45.1  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 		 584 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3082  two component sensor histidine kinase  29.03 
 
 		 477 aa  44.3  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  30.09 
 
 		 678 aa  44.7  0.005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.69 
 
 		 546 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003750  sensor histidine kinase  36.59 
 
 		 646 aa  44.3  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0232552  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0609  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  28.1 
 
 		 652 aa  43.9  0.006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3858  PAS sensor protein  31.13 
 
 		 797 aa  44.3  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2560  aerobic respiration control sensor protein ArcB  33.71 
 
 		 788 aa  43.9  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0089  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.31 
 
 		 587 aa  43.9  0.007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.81 
 
 		 463 aa  43.9  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2852  histidine kinase  30.93 
 
 		 1342 aa  43.9  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0012841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1503  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.98 
 
 		 483 aa  43.9  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.293022  normal  0.360603 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.34 
 
 		 379 aa  43.9  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1190  histidine kinase  35.58 
 
 		 484 aa  43.9  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.496715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.79 
 
 		 592 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.27 
 
 		 587 aa  43.9  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1240  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  30.84 
 
 		 541 aa  43.9  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000276458  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  23.26 
 
 		 1152 aa  43.9  0.008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.86 
 
 		 584 aa  43.5  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2528  histidine kinase  33.33 
 
 		 475 aa  43.5  0.009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00877701 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1987  multi-sensor hybrid histidine kinase  23.39 
 
 		 767 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.83 
 
 		 425 aa  43.5  0.009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  33.64 
 
 		 610 aa  43.5  0.01  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.32 
 
 		 722 aa  43.5  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3736  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  24.29 
 
 		 483 aa  43.5  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.509679  hitchhiker  0.0032323 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 456 aa  43.5  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1528  histidine kinase  24.79 
 
 		 389 aa  43.5  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>