34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38840 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  100 
 
 		 682 aa  1411    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  46.44 
 
 		 672 aa  520  1e-146  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  33.15 
 
 		 530 aa  290  4e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  30.67 
 
 		 528 aa  275  3e-72  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  31.69 
 
 		 531 aa  272  1e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  31.08 
 
 		 516 aa  271  2e-71  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  30.07 
 
 		 528 aa  268  2.9999999999999995e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  30.54 
 
 		 528 aa  267  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  30.35 
 
 		 530 aa  266  8.999999999999999e-70  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  32.34 
 
 		 526 aa  251  3e-65  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  28.77 
 
 		 663 aa  219  8.999999999999998e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  28.52 
 
 		 613 aa  215  1.9999999999999998e-54  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  28.16 
 
 		 621 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  27.77 
 
 		 622 aa  210  6e-53  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  27.3 
 
 		 604 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  27.8 
 
 		 689 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  27.47 
 
 		 697 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  27.74 
 
 		 600 aa  198  3e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  26.59 
 
 		 600 aa  196  1e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  27.06 
 
 		 697 aa  188  3e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  25.91 
 
 		 600 aa  187  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  28.41 
 
 		 600 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  26.92 
 
 		 606 aa  183  9.000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  34.52 
 
 		 626 aa  140  7e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  29.82 
 
 		 807 aa  109  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  30.37 
 
 		 825 aa  102  2e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  29.86 
 
 		 807 aa  101  4e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  27.52 
 
 		 824 aa  98.6  4e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  28.27 
 
 		 818 aa  93.6  1e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  26.14 
 
 		 662 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  27.36 
 
 		 664 aa  81.6  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  28.49 
 
 		 666 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  28.26 
 
 		 664 aa  76.3  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  29.12 
 
 		 664 aa  76.6  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>