42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1754 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  67.74 
 
 		 530 aa  764    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 531 aa  1081    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  45.22 
 
 		 530 aa  466  9.999999999999999e-131  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  45.89 
 
 		 526 aa  464  1e-129  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  44.09 
 
 		 528 aa  456  1e-127  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  44.53 
 
 		 516 aa  455  1e-127  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  44.64 
 
 		 528 aa  457  1e-127  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  44.89 
 
 		 528 aa  457  1e-127  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  36.22 
 
 		 600 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  36.74 
 
 		 600 aa  329  7e-89  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  36 
 
 		 663 aa  322  9.000000000000001e-87  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  34.18 
 
 		 622 aa  320  3e-86  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  34.98 
 
 		 600 aa  319  7.999999999999999e-86  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  33.86 
 
 		 606 aa  317  3e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  35.16 
 
 		 600 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  37.13 
 
 		 613 aa  311  2e-83  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  33.27 
 
 		 621 aa  301  2e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  31.15 
 
 		 682 aa  275  1.0000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  29.5 
 
 		 697 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  28.9 
 
 		 604 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  29.39 
 
 		 697 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  29.34 
 
 		 689 aa  243  5e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  32.34 
 
 		 672 aa  235  1.0000000000000001e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  45.93 
 
 		 626 aa  224  2e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  38.91 
 
 		 825 aa  192  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  39.11 
 
 		 818 aa  192  2e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  38.55 
 
 		 824 aa  188  2e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  37.59 
 
 		 807 aa  177  5e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  37.5 
 
 		 807 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  34.69 
 
 		 662 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  34.22 
 
 		 664 aa  147  3e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  33.71 
 
 		 664 aa  146  9e-34  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  33.08 
 
 		 666 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  33.08 
 
 		 664 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  26.56 
 
 		 881 aa  49.7  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  25.13 
 
 		 882 aa  47.8  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2230  histidine kinase  39.02 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50315  predicted protein  23.98 
 
 		 668 aa  46.2  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.21 
 
 		 597 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2178  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 750 aa  43.9  0.008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00477296  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4526  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 772 aa  43.5  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.99 
 
 		 597 aa  43.5  0.01  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>