47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1947 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  100 
 
 		 530 aa  1069    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  67.74 
 
 		 531 aa  764    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  49.51 
 
 		 528 aa  496  1e-139  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  48.92 
 
 		 526 aa  493  9.999999999999999e-139  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  48.44 
 
 		 530 aa  485  1e-136  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  47.44 
 
 		 528 aa  477  1e-133  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  48.13 
 
 		 528 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  46.36 
 
 		 516 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  36.77 
 
 		 663 aa  320  3e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  35.29 
 
 		 600 aa  318  2e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  37.3 
 
 		 613 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  35.39 
 
 		 621 aa  302  8.000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  34.11 
 
 		 600 aa  300  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  33.27 
 
 		 606 aa  298  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  33.74 
 
 		 622 aa  293  5e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  33.15 
 
 		 682 aa  291  2e-77  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  33.47 
 
 		 600 aa  289  8e-77  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  33.68 
 
 		 600 aa  289  8e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  27.72 
 
 		 697 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  28.88 
 
 		 604 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  28.88 
 
 		 697 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  28.7 
 
 		 689 aa  251  2e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  32.03 
 
 		 672 aa  230  4e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  42.15 
 
 		 626 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  35.27 
 
 		 825 aa  180  4.999999999999999e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  34.8 
 
 		 818 aa  175  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  34.44 
 
 		 807 aa  173  6.999999999999999e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.3 
 
 		 824 aa  171  4e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  34.31 
 
 		 807 aa  167  5e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  35.25 
 
 		 662 aa  147  6e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  33.33 
 
 		 664 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  33.33 
 
 		 664 aa  141  3e-32  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  32.61 
 
 		 664 aa  137  4e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  32.58 
 
 		 666 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  24.61 
 
 		 882 aa  52.8  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0401  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.43 
 
 		 415 aa  50.8  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.653943 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  40 
 
 		 124 aa  48.9  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.29 
 
 		 537 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0319  DNA-formamidopyrimidine glycosylase  32.47 
 
 		 271 aa  45.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.877297  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5017  histidine kinase  31.63 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 		 597 aa  44.7  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  41.07 
 
 		 122 aa  44.7  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 722 aa  44.3  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  27.23 
 
 		 881 aa  44.7  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3738  histidine kinase  35.64 
 
 		 601 aa  43.9  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018214  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 592 aa  43.5  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2867  sensor histidine kinase  31.4 
 
 		 463 aa  43.5  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0147797  normal  0.0868919 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>