51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2728 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  64.87 
 
 		 818 aa  1077    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  65.83 
 
 		 825 aa  1096    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 807 aa  1650    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  66.67 
 
 		 824 aa  1113    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  68 
 
 		 807 aa  1087    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  58.55 
 
 		 613 aa  335  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  57.14 
 
 		 621 aa  330  7e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  53.85 
 
 		 622 aa  323  9.999999999999999e-87  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  54.15 
 
 		 663 aa  314  3.9999999999999997e-84  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  49.45 
 
 		 600 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  51.84 
 
 		 600 aa  302  2e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  53.7 
 
 		 606 aa  301  3e-80  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  50 
 
 		 600 aa  293  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  48.89 
 
 		 600 aa  289  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  46.49 
 
 		 697 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  46.49 
 
 		 689 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  46.49 
 
 		 697 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  47.69 
 
 		 604 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  37.73 
 
 		 662 aa  195  3e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  40.22 
 
 		 664 aa  194  4e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  39.48 
 
 		 664 aa  192  2e-47  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  37.96 
 
 		 666 aa  191  4e-47  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  39.11 
 
 		 664 aa  191  4e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  35.02 
 
 		 528 aa  178  4e-43  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  37.59 
 
 		 531 aa  177  9e-43  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  33.58 
 
 		 530 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.44 
 
 		 530 aa  173  1e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  33.82 
 
 		 528 aa  172  2e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  32.85 
 
 		 528 aa  170  1e-40  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  34.66 
 
 		 516 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  31.75 
 
 		 526 aa  167  5e-40  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  37.17 
 
 		 626 aa  140  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  29.82 
 
 		 682 aa  109  2e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  30.35 
 
 		 672 aa  98.2  6e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  34.86 
 
 		 882 aa  53.9  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.46 
 
 		 335 aa  51.2  0.00007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 		 449 aa  50.1  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0547  histidine kinase  31.2 
 
 		 527 aa  47.8  0.0008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2624  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.48 
 
 		 435 aa  46.2  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000000009971 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  29.79 
 
 		 881 aa  46.6  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  42.86 
 
 		 371 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 		 454 aa  45.8  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 451 aa  45.8  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.66 
 
 		 451 aa  45.8  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12648  Signal Transduction Histidine Kinase (STHK) with CheB and CheRactivity  29.57 
 
 		 1200 aa  45.4  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2733  ATP-binding region ATPase domain protein  37.5 
 
 		 355 aa  44.7  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3705  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  31.31 
 
 		 527 aa  44.3  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4321  histidine kinase  44 
 
 		 1355 aa  44.3  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.295286 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  25.57 
 
 		 651 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0283  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  34.67 
 
 		 531 aa  44.3  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  25.25 
 
 		 651 aa  44.3  0.01  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>