50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2807 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 621 aa  1270    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  59.81 
 
 		 613 aa  767    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  74.07 
 
 		 622 aa  972    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  50.56 
 
 		 663 aa  599  1e-170  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  48.63 
 
 		 606 aa  543  1e-153  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  47.1 
 
 		 600 aa  533  1e-150  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  47.1 
 
 		 600 aa  532  1e-150  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  46.61 
 
 		 600 aa  523  1e-147  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  46.47 
 
 		 600 aa  521  1e-146  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  42.63 
 
 		 697 aa  456  1e-127  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  41.89 
 
 		 697 aa  442  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  41 
 
 		 689 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  40.68 
 
 		 604 aa  433  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  55.62 
 
 		 825 aa  343  4e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  59.14 
 
 		 824 aa  337  2.9999999999999997e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  60.22 
 
 		 818 aa  333  4e-90  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  57.14 
 
 		 807 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  54.55 
 
 		 807 aa  318  2e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  35.66 
 
 		 528 aa  313  6.999999999999999e-84  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  32.7 
 
 		 516 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  34.16 
 
 		 528 aa  303  4.0000000000000003e-81  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  35.47 
 
 		 530 aa  303  5.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  37.08 
 
 		 528 aa  303  6.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  35.39 
 
 		 530 aa  302  1e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  33.27 
 
 		 531 aa  301  2e-80  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  35.39 
 
 		 526 aa  301  3e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  28.16 
 
 		 682 aa  215  1.9999999999999998e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  41.7 
 
 		 666 aa  208  3e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  40.66 
 
 		 664 aa  204  5e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  41.24 
 
 		 664 aa  203  7e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  40.88 
 
 		 664 aa  203  8e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  41.83 
 
 		 662 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  26.74 
 
 		 672 aa  163  7e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  36.06 
 
 		 626 aa  136  9e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  39.73 
 
 		 882 aa  51.2  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  29.91 
 
 		 356 aa  49.3  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4529  sensor histidine kinase  31.19 
 
 		 418 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.8518  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  26.85 
 
 		 591 aa  46.2  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 597 aa  46.2  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4510  sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 418 aa  45.1  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0814506  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0868  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.46 
 
 		 650 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 335 aa  45.1  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 390 aa  45.1  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4927  sensor histidine kinase  35.53 
 
 		 417 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4895  sensor histidine kinase  35.53 
 
 		 418 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4669  sensor histidine kinase  35.53 
 
 		 418 aa  44.3  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5029  sensor histidine kinase  35.53 
 
 		 418 aa  44.3  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 379 aa  44.3  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4894  sensor histidine kinase  34.21 
 
 		 417 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5228  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1224 aa  43.9  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>