More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_1445 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_1445  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 390 aa  786    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4273  two-component sensor  38.85 
 
 		 402 aa  241  1e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.595871  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0774  sensor histidine kinase  40.31 
 
 		 397 aa  239  6.999999999999999e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.307711 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2192  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  37.05 
 
 		 442 aa  233  4.0000000000000004e-60  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2000  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 		 411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3050  histidine kinase  40.18 
 
 		 398 aa  233  6e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1533  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 		 403 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2898  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.27 
 
 		 386 aa  228  1e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0230241  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1720  flagellar regulatory protein B  40.41 
 
 		 351 aa  227  3e-58  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00341718  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3697  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 405 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.194004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50200  two-component sensor  38.85 
 
 		 402 aa  225  9e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000583337 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2828  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.22 
 
 		 409 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.453157  normal  0.0182492 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2311  histidine kinase  39.1 
 
 		 347 aa  223  4e-57  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3460  flagellar sensor histidine kinase FleS  37.5 
 
 		 404 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03165  hypothetical protein  38.67 
 
 		 345 aa  209  5e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02892  putative sensory box sensor histidine kinase in two-component regulatory system  37.91 
 
 		 380 aa  209  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002812  flagellar sensor histidine kinase FleS  38.86 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3933  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 405 aa  205  9e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.571484  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2579  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.86 
 
 		 360 aa  202  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4372  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.91149 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1495  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.03 
 
 		 405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.702129 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2929  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 360 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1358  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.97 
 
 		 371 aa  197  3e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 360 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1955  sensor histidine kinase FleS  36.44 
 
 		 368 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.189576  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.86 
 
 		 370 aa  194  2e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1179  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 356 aa  192  1e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1363  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.73 
 
 		 362 aa  189  7e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1321  ATP-binding region, ATPase-like protein  33.83 
 
 		 356 aa  186  6e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3069  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 		 371 aa  186  6e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1499  flagellar regulatory protein B  34.1 
 
 		 431 aa  183  5.0000000000000004e-45  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440819  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1346  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 360 aa  177  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1339  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 		 360 aa  177  4e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.400038 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3231  flagellar regulatory protein B  34.34 
 
 		 360 aa  176  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1279  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 360 aa  176  8e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3451  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 384 aa  175  9.999999999999999e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1727  hypothetical protein  31.29 
 
 		 343 aa  165  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1727  hypothetical protein  30.99 
 
 		 343 aa  164  3e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0426  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.05 
 
 		 598 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.830485  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2300  flagellar regulatory protein B  33.03 
 
 		 357 aa  154  2e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1470  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 755 aa  144  2e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.797654  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1424  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.73 
 
 		 720 aa  142  9e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.916012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1029  two-component sensor CbrA  28.65 
 
 		 986 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.211087  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1139  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.6 
 
 		 578 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0768  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 673 aa  137  4e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670648  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1004  sensory box histidine kinase  30.86 
 
 		 363 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.27324  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 378 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1628  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 929 aa  136  6.0000000000000005e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0547  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 		 731 aa  136  8e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0016  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.85 
 
 		 679 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.225702  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02146  sensory histidine kinase in two-component regulatory system with AtoC  27.89 
 
 		 608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1439  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.89 
 
 		 608 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.36941  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0471  sensor histidine kinase  34.27 
 
 		 419 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.328588  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1431  sensory histidine kinase AtoS  27.89 
 
 		 608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.250093  hitchhiker  0.00150562 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02105  hypothetical protein  27.89 
 
 		 608 aa  135  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0670  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  28.8 
 
 		 546 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0451507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2360  sensory histidine kinase AtoS  27.89 
 
 		 608 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00013069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2368  sensory histidine kinase AtoS  27.89 
 
 		 608 aa  134  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0221711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2562  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.86 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00117213 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1590  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.06 
 
 		 447 aa  134  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.632481 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2017  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.07 
 
 		 422 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2808  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 595 aa  134  3.9999999999999996e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.277541  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1012  sensory histidine kinase AtoS  31.91 
 
 		 611 aa  133  6e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0763097 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29 
 
 		 456 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0915  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.95 
 
 		 362 aa  132  9e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.115848  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2551  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.49 
 
 		 396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.14529e-19 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2806  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.27 
 
 		 361 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1404  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30.57 
 
 		 361 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000236023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 		 396 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1384  sensory histidine kinase AtoS  28.17 
 
 		 617 aa  130  3e-29  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1311  sensory histidine kinase AtoS  28.53 
 
 		 614 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0625  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.92 
 
 		 526 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0172  sensory histidine kinase AtoS  28.25 
 
 		 621 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.557198  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2454  histidine kinase  34.76 
 
 		 367 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000691569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0659  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 525 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0018  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.89 
 
 		 710 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.2698 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0659  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.89 
 
 		 525 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0828  sensory histidine kinase AtoS  28.32 
 
 		 613 aa  128  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.167481 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.11 
 
 		 505 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2943  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.45 
 
 		 586 aa  127  3e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1751  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 		 671 aa  127  5e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.1 
 
 		 733 aa  126  6e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.589571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2201  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.44 
 
 		 480 aa  126  7e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3269  sensor protein  32.51 
 
 		 619 aa  125  9e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3414  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.49 
 
 		 406 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  29.47 
 
 		 975 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1841  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.97 
 
 		 832 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.193006  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1494  sensory box histidine kinase  30.6 
 
 		 550 aa  124  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102326  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1578  histidine kinase  25.93 
 
 		 829 aa  125  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1658  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.83 
 
 		 579 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0362267  normal  0.337398 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2146  two component signal transduction histidine kinase  27.3 
 
 		 559 aa  124  3e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2821  sensory box histidine kinase  26.74 
 
 		 604 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2908  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  26.74 
 
 		 604 aa  124  3e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.293686  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0213  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.92 
 
 		 722 aa  124  3e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100019 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0084  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 372 aa  124  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2854  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.05 
 
 		 368 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.834527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2787  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.97 
 
 		 365 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.220649  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.94 
 
 		 781 aa  123  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.276593  decreased coverage  0.00464659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>