36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0742 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  100 
 
 		 663 aa  1346    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  51.19 
 
 		 622 aa  619  1e-176  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  50.56 
 
 		 621 aa  600  1e-170  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  50.16 
 
 		 613 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  47.56 
 
 		 600 aa  513  1e-144  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  49.02 
 
 		 606 aa  515  1e-144  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  48.48 
 
 		 600 aa  504  1e-141  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  48.27 
 
 		 600 aa  493  9.999999999999999e-139  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  44.05 
 
 		 689 aa  473  1e-132  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  45.71 
 
 		 600 aa  475  1e-132  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  43.57 
 
 		 604 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  43.87 
 
 		 697 aa  471  1.0000000000000001e-131  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  42.44 
 
 		 697 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  36 
 
 		 531 aa  322  9.999999999999999e-87  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  36.77 
 
 		 530 aa  320  3.9999999999999996e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  54.15 
 
 		 807 aa  314  2.9999999999999996e-84  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  36.71 
 
 		 528 aa  311  2e-83  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  54.18 
 
 		 807 aa  311  2.9999999999999997e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  37.65 
 
 		 516 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  37.06 
 
 		 526 aa  306  6e-82  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  53.24 
 
 		 818 aa  306  8.000000000000001e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  49.22 
 
 		 825 aa  305  2.0000000000000002e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  35.82 
 
 		 530 aa  303  6.000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  53.79 
 
 		 824 aa  303  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  36.57 
 
 		 528 aa  302  1e-80  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  36.12 
 
 		 528 aa  293  7e-78  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  28.77 
 
 		 682 aa  221  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  40.77 
 
 		 666 aa  207  7e-52  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  39.85 
 
 		 664 aa  203  8e-51  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  39.1 
 
 		 664 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  39.1 
 
 		 664 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  39.47 
 
 		 662 aa  201  3e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  29.2 
 
 		 672 aa  196  1e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  37.86 
 
 		 626 aa  156  1e-36  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1497  ATPase domain-containing protein  31.74 
 
 		 945 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0028368  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  33.33 
 
 		 882 aa  44.7  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>