59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_1391 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 530 aa  1085    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  89.39 
 
 		 528 aa  983    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  87.24 
 
 		 526 aa  967    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  88.02 
 
 		 528 aa  973    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  57.73 
 
 		 528 aa  614  9.999999999999999e-175  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  52.4 
 
 		 516 aa  543  1e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  48.44 
 
 		 530 aa  485  1e-136  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  45.22 
 
 		 531 aa  466  9.999999999999999e-131  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  35.97 
 
 		 600 aa  319  7e-86  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  35.47 
 
 		 621 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  35.82 
 
 		 663 aa  303  4.0000000000000003e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  36.11 
 
 		 600 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  34.85 
 
 		 622 aa  296  7e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  33.2 
 
 		 600 aa  294  3e-78  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  35.46 
 
 		 600 aa  293  4e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  33.08 
 
 		 606 aa  290  6e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  32.14 
 
 		 613 aa  281  2e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  30.35 
 
 		 682 aa  266  5e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  29.78 
 
 		 697 aa  259  6e-68  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  29.86 
 
 		 604 aa  252  1e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  30.04 
 
 		 697 aa  249  9e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  29.43 
 
 		 689 aa  249  1e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  30.93 
 
 		 672 aa  227  4e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  40.38 
 
 		 626 aa  189  8e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  35.58 
 
 		 825 aa  182  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.2 
 
 		 824 aa  179  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  33.58 
 
 		 807 aa  174  5e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  35.82 
 
 		 807 aa  169  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  34.08 
 
 		 818 aa  169  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  31.87 
 
 		 664 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  31.08 
 
 		 664 aa  117  6e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  31.08 
 
 		 664 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  32.37 
 
 		 662 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  30.96 
 
 		 666 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.83 
 
 		 1003 aa  50.8  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  39.29 
 
 		 418 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0134  histidine kinase  34.44 
 
 		 547 aa  47.8  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  34.94 
 
 		 418 aa  47.8  0.0005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 		 597 aa  47.4  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.83 
 
 		 524 aa  47.4  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 488 aa  47  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.93 
 
 		 718 aa  46.6  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.8 
 
 		 420 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3721  heavy metal sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 482 aa  45.8  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 419 aa  45.4  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  28.57 
 
 		 655 aa  45.4  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 722 aa  44.7  0.004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 589 aa  45.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.96 
 
 		 379 aa  44.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1067  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 425 aa  44.3  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.312987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2530  histidine kinase  31.03 
 
 		 439 aa  44.3  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.9 
 
 		 597 aa  44.3  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4320  histidine kinase  30.95 
 
 		 518 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0320579 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4210  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.95 
 
 		 518 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  38.6 
 
 		 540 aa  43.5  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  29.85 
 
 		 882 aa  43.5  0.008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 595 aa  43.5  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1448  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 524 aa  43.5  0.01  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>