37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1735 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  69.83 
 
 		 600 aa  881    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 600 aa  1236    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  66.95 
 
 		 606 aa  858    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  68.33 
 
 		 600 aa  879    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  66.67 
 
 		 600 aa  858    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  47.35 
 
 		 622 aa  551  1e-155  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  48.14 
 
 		 613 aa  543  1e-153  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  46.61 
 
 		 621 aa  523  1e-147  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  48.48 
 
 		 663 aa  504  1e-141  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  40.38 
 
 		 697 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  40.84 
 
 		 697 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  40.46 
 
 		 689 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  40.53 
 
 		 604 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  36.74 
 
 		 531 aa  329  8e-89  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  34.87 
 
 		 516 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  54.38 
 
 		 818 aa  310  6.999999999999999e-83  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  52.21 
 
 		 825 aa  309  8e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  52.57 
 
 		 824 aa  307  3e-82  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  52 
 
 		 807 aa  301  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.11 
 
 		 530 aa  300  6e-80  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  34.26 
 
 		 526 aa  300  6e-80  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  35.1 
 
 		 528 aa  299  8e-80  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  34.26 
 
 		 528 aa  299  1e-79  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  33.2 
 
 		 530 aa  294  4e-78  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  48.89 
 
 		 807 aa  289  9e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  33.27 
 
 		 528 aa  287  5e-76  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  39.86 
 
 		 664 aa  210  7e-53  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  40.58 
 
 		 664 aa  209  1e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  40.58 
 
 		 664 aa  208  2e-52  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  37.68 
 
 		 666 aa  201  3e-50  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  39.39 
 
 		 662 aa  196  8.000000000000001e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  26.59 
 
 		 682 aa  196  9e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  29 
 
 		 672 aa  188  3e-46  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  37.92 
 
 		 626 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  26.57 
 
 		 882 aa  49.3  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  30.3 
 
 		 881 aa  45.1  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4723  GAF sensor Signal transduction histidine kinase  26.83 
 
 		 670 aa  44.3  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>