36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_2840 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  98.18 
 
 		 697 aa  1219    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 604 aa  1237    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  98.01 
 
 		 689 aa  1218    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  85.62 
 
 		 697 aa  1070    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  43.57 
 
 		 663 aa  469  1.0000000000000001e-131  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  42.65 
 
 		 622 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  41.94 
 
 		 621 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  43.71 
 
 		 613 aa  433  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  42.36 
 
 		 606 aa  409  1e-113  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  40.7 
 
 		 600 aa  402  1e-111  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  40.68 
 
 		 600 aa  396  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  40.14 
 
 		 600 aa  395  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  40.33 
 
 		 600 aa  383  1e-105  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  50.17 
 
 		 818 aa  292  1e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  49.12 
 
 		 825 aa  282  1e-74  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  47.69 
 
 		 807 aa  281  3e-74  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  49.82 
 
 		 824 aa  279  1e-73  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  47.02 
 
 		 807 aa  276  7e-73  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  29.89 
 
 		 528 aa  264  4e-69  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  30.86 
 
 		 528 aa  261  3e-68  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  31.87 
 
 		 516 aa  259  8e-68  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  30.04 
 
 		 530 aa  253  7e-66  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  29.06 
 
 		 530 aa  253  7e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  29.39 
 
 		 531 aa  246  9.999999999999999e-64  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  29.2 
 
 		 528 aa  246  9.999999999999999e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  30.43 
 
 		 526 aa  242  1e-62  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  29.37 
 
 		 626 aa  234  3e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  27.3 
 
 		 682 aa  201  3.9999999999999996e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  37.55 
 
 		 666 aa  188  3e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  40.07 
 
 		 664 aa  186  9e-46  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  38.97 
 
 		 664 aa  184  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  38.97 
 
 		 664 aa  184  5.0000000000000004e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  38.38 
 
 		 662 aa  180  7e-44  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  24.71 
 
 		 672 aa  176  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  32.17 
 
 		 882 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2654  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.85 
 
 		 812 aa  46.2  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>