40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1670 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 664 aa  1363    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  97.14 
 
 		 664 aa  1289    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  72.15 
 
 		 662 aa  959    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  87.24 
 
 		 666 aa  1198    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  96.39 
 
 		 664 aa  1299    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  40.58 
 
 		 600 aa  208  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  39.86 
 
 		 600 aa  207  4e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  42.45 
 
 		 600 aa  205  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  42.75 
 
 		 600 aa  205  2e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  40.88 
 
 		 621 aa  203  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  39.1 
 
 		 663 aa  201  1.9999999999999998e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  37.32 
 
 		 622 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  41.63 
 
 		 825 aa  196  8.000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  39.33 
 
 		 807 aa  196  9e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  40.3 
 
 		 613 aa  194  6e-48  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  39.11 
 
 		 807 aa  191  4e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  38.99 
 
 		 824 aa  191  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  38.01 
 
 		 818 aa  189  1e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  38.49 
 
 		 697 aa  187  7e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  38.24 
 
 		 606 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  37.99 
 
 		 689 aa  185  3e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  37.99 
 
 		 697 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  38.38 
 
 		 604 aa  184  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  33.71 
 
 		 531 aa  146  9e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  33.33 
 
 		 530 aa  141  3e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  35.66 
 
 		 516 aa  140  7.999999999999999e-32  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  34.11 
 
 		 626 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  34.8 
 
 		 528 aa  130  8.000000000000001e-29  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  32.61 
 
 		 528 aa  120  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  32.34 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  30.68 
 
 		 526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  31.08 
 
 		 530 aa  116  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  30.65 
 
 		 672 aa  98.2  4e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  27.86 
 
 		 682 aa  87.4  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  32.1 
 
 		 882 aa  48.5  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  24.05 
 
 		 669 aa  47.8  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2572  HSP90 family molecular chaperone-like protein  30.28 
 
 		 881 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.710884  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4375  histidine kinase  33.87 
 
 		 246 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.821141  decreased coverage  0.0094806 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  30.97 
 
 		 1202 aa  45.4  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1269  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  27.7 
 
 		 416 aa  44.3  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.906191  normal  0.151074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>