41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2919 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  64.77 
 
 		 600 aa  811    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  66.95 
 
 		 600 aa  858    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 606 aa  1247    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  65.6 
 
 		 600 aa  827    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  63.09 
 
 		 600 aa  781    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  50.43 
 
 		 622 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  49.57 
 
 		 613 aa  549  1e-155  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  48.63 
 
 		 621 aa  543  1e-153  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  49.02 
 
 		 663 aa  514  1e-144  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  42.49 
 
 		 697 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  40.98 
 
 		 697 aa  404  1e-111  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  41.45 
 
 		 689 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  41.65 
 
 		 604 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  33.86 
 
 		 531 aa  317  4e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  58.82 
 
 		 818 aa  314  3.9999999999999997e-84  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  56.67 
 
 		 824 aa  312  1e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  55.56 
 
 		 825 aa  310  5e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  53.7 
 
 		 807 aa  301  2e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  34.17 
 
 		 516 aa  300  6e-80  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  33.27 
 
 		 530 aa  298  2e-79  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  54.38 
 
 		 807 aa  292  1e-77  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  33.08 
 
 		 530 aa  290  7e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  36.68 
 
 		 528 aa  288  1e-76  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  32.38 
 
 		 528 aa  287  4e-76  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  33.59 
 
 		 528 aa  283  6.000000000000001e-75  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  34.6 
 
 		 526 aa  282  1e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  38.24 
 
 		 664 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  38.24 
 
 		 664 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  38.24 
 
 		 664 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  37.82 
 
 		 662 aa  184  6e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  26.92 
 
 		 682 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  38.13 
 
 		 666 aa  177  4e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  27.67 
 
 		 672 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  36.02 
 
 		 626 aa  163  9e-39  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  47.27 
 
 		 882 aa  52  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4717  sensor histidine kinase  36.84 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0622  sensor histidine kinase  36.84 
 
 		 484 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1699  ATP-binding region, ATPase-like protein  27.27 
 
 		 1396 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.170141  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0227  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.67 
 
 		 482 aa  44.7  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.60128 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1356  histidine kinase  29.82 
 
 		 591 aa  44.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.272397  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  28.4 
 
 		 322 aa  43.9  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>