40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0599 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  59.81 
 
 		 621 aa  767    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 613 aa  1239    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  59.93 
 
 		 622 aa  775    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  50.16 
 
 		 663 aa  578  1.0000000000000001e-163  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  49.57 
 
 		 606 aa  549  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  48.14 
 
 		 600 aa  543  1e-153  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  47.95 
 
 		 600 aa  540  9.999999999999999e-153  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  48.46 
 
 		 600 aa  535  1e-151  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  47.37 
 
 		 600 aa  536  1e-151  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  43.55 
 
 		 697 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  44.23 
 
 		 689 aa  436  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  43.85 
 
 		 697 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  43.52 
 
 		 604 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  58.55 
 
 		 807 aa  335  1e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  58.61 
 
 		 824 aa  334  3e-90  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  58.24 
 
 		 825 aa  333  7.000000000000001e-90  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  58.12 
 
 		 818 aa  330  5.0000000000000004e-89  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  56.68 
 
 		 807 aa  323  7e-87  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  37.3 
 
 		 530 aa  313  3.9999999999999997e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  37.13 
 
 		 531 aa  311  2e-83  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  35.71 
 
 		 528 aa  304  3.0000000000000004e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  34.35 
 
 		 516 aa  298  2e-79  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  32.14 
 
 		 530 aa  281  2e-74  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  33.2 
 
 		 528 aa  281  3e-74  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  32.58 
 
 		 526 aa  280  5e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  32.67 
 
 		 528 aa  278  1e-73  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  28.7 
 
 		 682 aa  214  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  30.7 
 
 		 672 aa  206  7e-52  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  41.5 
 
 		 666 aa  202  9.999999999999999e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  43.37 
 
 		 662 aa  199  9e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  40.07 
 
 		 664 aa  197  5.000000000000001e-49  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  40.67 
 
 		 664 aa  196  1e-48  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  40.3 
 
 		 664 aa  194  5e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  35.21 
 
 		 626 aa  140  7.999999999999999e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  34.75 
 
 		 882 aa  59.7  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.69 
 
 		 467 aa  45.4  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0878  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 		 840 aa  45.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00403234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 335 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2789  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 677 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2927  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 672 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.600674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>