64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1314 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  70.55 
 
 		 824 aa  1147    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  71.1 
 
 		 825 aa  1172    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 818 aa  1655    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  64.87 
 
 		 807 aa  1089    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  67.4 
 
 		 807 aa  1071    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  60.22 
 
 		 621 aa  333  6e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  58.76 
 
 		 622 aa  332  2e-89  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  58.12 
 
 		 613 aa  331  4e-89  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  57.88 
 
 		 600 aa  319  1e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  58.82 
 
 		 606 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  53.07 
 
 		 600 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  55.84 
 
 		 600 aa  312  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  54.38 
 
 		 600 aa  310  6.999999999999999e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  53.24 
 
 		 663 aa  306  7e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  47.65 
 
 		 697 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  47.65 
 
 		 689 aa  298  3e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  47.18 
 
 		 604 aa  294  6e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  50.34 
 
 		 697 aa  291  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  39.11 
 
 		 531 aa  192  2e-47  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  38.51 
 
 		 664 aa  191  5.999999999999999e-47  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  38.01 
 
 		 664 aa  190  1e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  37.46 
 
 		 664 aa  190  1e-46  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  38.05 
 
 		 666 aa  188  4e-46  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  35.37 
 
 		 662 aa  186  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.8 
 
 		 530 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  36.26 
 
 		 528 aa  174  3.9999999999999995e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  36.43 
 
 		 516 aa  173  1e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  34.44 
 
 		 528 aa  172  3e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  34.08 
 
 		 530 aa  169  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  32.58 
 
 		 526 aa  165  3e-39  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  32.96 
 
 		 528 aa  163  1e-38  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  34.82 
 
 		 626 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  28.33 
 
 		 672 aa  108  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  25.9 
 
 		 682 aa  94.4  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  34.23 
 
 		 882 aa  53.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 454 aa  53.1  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  33.12 
 
 		 540 aa  49.3  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 		 454 aa  48.1  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 449 aa  47.8  0.0009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  29.73 
 
 		 378 aa  46.6  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  37.84 
 
 		 394 aa  46.6  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0436  sensor histidine kinase  30.08 
 
 		 460 aa  46.6  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 379 aa  47  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2733  ATP-binding region ATPase domain protein  41.07 
 
 		 355 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.91 
 
 		 335 aa  45.8  0.003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 379 aa  45.4  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 467 aa  45.4  0.004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6120  histidine kinase  31.97 
 
 		 606 aa  45.4  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.198202  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 444 aa  45.4  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 451 aa  45.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.38 
 
 		 451 aa  45.4  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4840  sensory histidine kinase CreC  30.77 
 
 		 474 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.391423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A5001  sensory histidine kinase CreC  30.77 
 
 		 474 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4913  sensory histidine kinase CreC  30.77 
 
 		 474 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4999  sensory histidine kinase CreC  30.77 
 
 		 474 aa  45.4  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.287033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4947  sensory histidine kinase CreC  30.77 
 
 		 474 aa  45.1  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.298801  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  36.49 
 
 		 395 aa  45.4  0.005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  26.12 
 
 		 356 aa  45.1  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0149  sensor histidine kinase/response regulator  35.23 
 
 		 371 aa  45.1  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0804  histidine kinase  31.11 
 
 		 322 aa  44.7  0.008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0156746  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1667  sensor histidine kinase  32 
 
 		 652 aa  44.7  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.976342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 		 443 aa  44.3  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.269613 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0279  histidine kinase  28.33 
 
 		 461 aa  44.3  0.01  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1194  sensor histidine kinase  31.18 
 
 		 466 aa  44.3  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.755986  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>