56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0639 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  100 
 
 		 824 aa  1669    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  85.52 
 
 		 825 aa  1417    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  66.67 
 
 		 807 aa  1128    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  70.55 
 
 		 818 aa  1147    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  68.48 
 
 		 807 aa  1090    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  59.14 
 
 		 621 aa  337  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  58.7 
 
 		 622 aa  335  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  58.61 
 
 		 613 aa  335  2e-90  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  56.67 
 
 		 606 aa  313  1e-83  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  51.27 
 
 		 600 aa  309  1.0000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  52.57 
 
 		 600 aa  308  3e-82  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  54.61 
 
 		 600 aa  308  3e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  53.79 
 
 		 663 aa  304  5.000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  52.94 
 
 		 600 aa  301  2e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  48.33 
 
 		 697 aa  282  2e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  47.67 
 
 		 689 aa  281  3e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  40.56 
 
 		 697 aa  281  4e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  49.82 
 
 		 604 aa  279  1e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  28.97 
 
 		 664 aa  266  1e-69  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  28.53 
 
 		 666 aa  265  2e-69  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  29.04 
 
 		 664 aa  265  3e-69  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  38.99 
 
 		 664 aa  192  2.9999999999999997e-47  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  38.55 
 
 		 531 aa  188  3e-46  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  36.71 
 
 		 662 aa  188  3e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  34.94 
 
 		 528 aa  184  7e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  34.2 
 
 		 530 aa  179  2e-43  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  33.09 
 
 		 526 aa  177  8e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  33.46 
 
 		 528 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  35.16 
 
 		 516 aa  171  4e-41  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.3 
 
 		 530 aa  171  6e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  34.21 
 
 		 528 aa  169  1e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  34.82 
 
 		 626 aa  143  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  27.65 
 
 		 672 aa  101  7e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  27.52 
 
 		 682 aa  99  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  33.01 
 
 		 882 aa  56.2  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3308  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 454 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9098  bacteriophytochrome protein  33.64 
 
 		 378 aa  50.1  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.384054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0224  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34 
 
 		 379 aa  49.3  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0795  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 444 aa  47  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3533  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 449 aa  47.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00670789  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3018  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 		 454 aa  46.2  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 456 aa  46.6  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4018  osmolarity sensor protein  31.82 
 
 		 440 aa  45.8  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.37 
 
 		 455 aa  45.8  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1293  sensory box sensor histidine kinase  36.49 
 
 		 394 aa  45.8  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00147637  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1521  DNA mismatch repair protein MutL  31.82 
 
 		 540 aa  45.4  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1156  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 451 aa  45.8  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00188627  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0767  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 451 aa  45.8  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0124  sensor histidine kinase  26.12 
 
 		 356 aa  45.4  0.004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3634  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.41 
 
 		 379 aa  45.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0261897  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.7 
 
 		 359 aa  44.7  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  25.51 
 
 		 635 aa  44.7  0.008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  34.17 
 
 		 649 aa  44.3  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1076  sensor histidine kinase  35.14 
 
 		 395 aa  44.3  0.009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.118073  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.09 
 
 		 374 aa  44.3  0.009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101669 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  29.78 
 
 		 652 aa  44.3  0.01  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>