59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcal_0942 on replicon NC_009073
Organism: Pyrobaculum calidifontis JCM 11548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  87.24 
 
 		 530 aa  967    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  87.86 
 
 		 528 aa  961    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 526 aa  1071    Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  84.76 
 
 		 528 aa  935    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  58.02 
 
 		 528 aa  623  1e-177  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  52.8 
 
 		 516 aa  545  1e-153  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  48.92 
 
 		 530 aa  493  9.999999999999999e-139  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  45.89 
 
 		 531 aa  464  1e-129  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  35.49 
 
 		 600 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  37.06 
 
 		 663 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  35.5 
 
 		 600 aa  306  8.000000000000001e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  35.39 
 
 		 621 aa  301  3e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  34.26 
 
 		 600 aa  300  5e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  35.96 
 
 		 622 aa  298  2e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  34.85 
 
 		 600 aa  297  4e-79  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  34.6 
 
 		 606 aa  282  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  32.58 
 
 		 613 aa  280  4e-74  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  29.68 
 
 		 672 aa  252  1e-65  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  32.34 
 
 		 682 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  30.66 
 
 		 697 aa  250  5e-65  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  30.25 
 
 		 604 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  29.25 
 
 		 689 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  29.51 
 
 		 697 aa  238  2e-61  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  40 
 
 		 626 aa  191  2e-47  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  33.09 
 
 		 824 aa  177  5e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  33.33 
 
 		 825 aa  175  1.9999999999999998e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  36.57 
 
 		 807 aa  168  2e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  31.75 
 
 		 807 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  32.58 
 
 		 818 aa  165  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  31.08 
 
 		 664 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  30.68 
 
 		 664 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  30.68 
 
 		 664 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  33.05 
 
 		 662 aa  118  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  31.17 
 
 		 666 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.82 
 
 		 418 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2879  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.71 
 
 		 1003 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.570063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2294  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 		 488 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3924  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.52 
 
 		 436 aa  47.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1456  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.746847 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.9 
 
 		 453 aa  46.6  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1438  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  39.76 
 
 		 394 aa  46.2  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210229  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0597  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  34.83 
 
 		 524 aa  46.6  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00345786 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0917  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.63 
 
 		 494 aa  46.6  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000856467  hitchhiker  9.75464e-20 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.71 
 
 		 718 aa  46.2  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2904  histidine kinase  38.37 
 
 		 876 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0209815 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 597 aa  45.4  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1370  ATP-binding region ATPase domain protein  32.33 
 
 		 882 aa  45.8  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.728434  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3865  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 420 aa  45.1  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 722 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0524  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.12 
 
 		 475 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1057  sensor histidine kinase  33.73 
 
 		 418 aa  44.7  0.004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.197208  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0941  histidine kinase  36.05 
 
 		 540 aa  44.3  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.036916  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0692  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.35 
 
 		 419 aa  44.3  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.640091 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0538  histidine kinase  33.77 
 
 		 336 aa  44.3  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000789394  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1274  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 589 aa  43.9  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.306932  normal  0.158909 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2434  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.94 
 
 		 662 aa  44.3  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  27.23 
 
 		 635 aa  44.3  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1494  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 527 aa  43.9  0.007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.101817  normal  0.2644 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.8 
 
 		 597 aa  43.5  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>