36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1408 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1408  DNA topoisomerase VI subunit B  100 
 
 		 626 aa  1289    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3024  DNA topoisomerase VI subunit B  28.94 
 
 		 697 aa  245  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1754  DNA topoisomerase VI subunit B  45.93 
 
 		 531 aa  225  2e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.259807  normal  0.193391 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1947  DNA topoisomerase VI, B subunit  39.32 
 
 		 530 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.333338  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0666  DNA topoisomerase VI subunit B  43.5 
 
 		 516 aa  213  9e-54  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.448413  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_49589  predicted protein  28.68 
 
 		 672 aa  204  4e-51  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00930668 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1219  DNA topoisomerase VI subunit B  41.11 
 
 		 528 aa  201  3e-50  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.259715  normal  0.851268 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0845  DNA topoisomerase VI subunit B  37.75 
 
 		 528 aa  192  1e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.534974  normal  0.175394 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0942  DNA topoisomerase VI subunit B  40.38 
 
 		 526 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1928  DNA topoisomerase VI subunit B  40.38 
 
 		 528 aa  191  5e-47  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1391  DNA topoisomerase VI subunit B  40.38 
 
 		 530 aa  189  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0742  DNA topoisomerase VI, B subunit  37.4 
 
 		 663 aa  179  1e-43  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00831988  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1735  DNA topoisomerase VI subunit B  37.92 
 
 		 600 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.105273  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1586  DNA topoisomerase VI subunit B  38.24 
 
 		 600 aa  170  7e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.760746  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2771  DNA topoisomerase VI subunit B  35.16 
 
 		 697 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2284  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.14 
 
 		 825 aa  165  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0639  DNA topoisomerase VI, B subunit  34.82 
 
 		 824 aa  163  8.000000000000001e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1314  DNA topoisomerase VI subunit B  34.82 
 
 		 818 aa  162  1e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0353052 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2919  DNA topoisomerase VI subunit B  36.02 
 
 		 606 aa  162  1e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.405903 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2840  DNA topoisomerase VI subunit B  33.33 
 
 		 604 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2197  DNA topoisomerase VI subunit B  35.34 
 
 		 600 aa  160  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2728  DNA topoisomerase VI subunit B  34.96 
 
 		 807 aa  160  8e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.853166  normal  0.559184 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2929  DNA topoisomerase VI subunit B  32.68 
 
 		 689 aa  160  8e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0130  DNA topoisomerase VI subunit B  35.34 
 
 		 807 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.941198  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0230  DNA topoisomerase VI subunit B  34.96 
 
 		 664 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.259945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0599  DNA topoisomerase VI subunit B  34.58 
 
 		 613 aa  155  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2807  DNA topoisomerase VI subunit B  35.27 
 
 		 621 aa  155  2e-36  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000949011  hitchhiker  0.00390833 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0808  DNA topoisomerase VI subunit B  34.96 
 
 		 664 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0416  DNA topoisomerase VI subunit B  32.27 
 
 		 600 aa  154  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.731049  hitchhiker  0.000993101 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1203  DNA topoisomerase VI subunit B  34.01 
 
 		 622 aa  154  5e-36  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.516515  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0438  DNA topoisomerase VI subunit B  36.93 
 
 		 662 aa  152  2e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0881156  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1670  DNA topoisomerase VI subunit B  33.33 
 
 		 664 aa  150  5e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.14216  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0315  DNA topoisomerase VI subunit B  32.93 
 
 		 666 aa  143  9e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38840  type II DNA topoisomerase 6 subunit  29.7 
 
 		 682 aa  142  9.999999999999999e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.833809  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1548  ATPase domain-containing protein  24.71 
 
 		 800 aa  46.2  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4377  ATPase domain-containing protein  26.44 
 
 		 594 aa  45.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>