More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3738 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3738  histidine kinase  100 
 
 
601 aa  1221    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000018214  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1400  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
591 aa  280  8e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0263941  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.89 
 
 
604 aa  275  2.0000000000000002e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
597 aa  271  2e-71  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3813  sensor histidine kinase ResE  33.6 
 
 
591 aa  270  5e-71  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000821443  hitchhiker  2.81471e-19 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1638  sensor histidine kinase ResE  33.17 
 
 
591 aa  266  8e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1360  sensor histidine kinase  33.17 
 
 
591 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000268966  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1570  sensor histidine kinase ResE  33.17 
 
 
591 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4159100000000003e-40 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1387  sensor histidine kinase ResE  33.77 
 
 
591 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1498  sensor histidine kinase ResE  33.77 
 
 
591 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000125371  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1602  sensor histidine kinase ResE  33.01 
 
 
591 aa  265  2e-69  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.144012  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1359  sensor histidine kinase  33.01 
 
 
591 aa  265  2e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.805336  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1201  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.82 
 
 
591 aa  265  2e-69  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.911638  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1532  sensor histidine kinase ResE  33.01 
 
 
591 aa  264  3e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0525759  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.48 
 
 
597 aa  262  1e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.06 
 
 
571 aa  261  2e-68  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.47 
 
 
590 aa  244  3.9999999999999997e-63  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.58 
 
 
458 aa  237  5.0000000000000005e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.06 
 
 
584 aa  234  3e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1579  histidine kinase  27.52 
 
 
583 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 
583 aa  233  8.000000000000001e-60  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  31.61 
 
 
613 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1054  sensor histidine kinase SrrB  27.6 
 
 
589 aa  231  2e-59  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.61 
 
 
592 aa  231  3e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 
611 aa  230  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.92 
 
 
584 aa  229  2e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
589 aa  225  2e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
621 aa  224  3e-57  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.91 
 
 
597 aa  224  4.9999999999999996e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  32.23 
 
 
613 aa  222  9.999999999999999e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  32.02 
 
 
613 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  32.02 
 
 
613 aa  223  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  32.02 
 
 
613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  31.61 
 
 
613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  32.02 
 
 
613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  32.02 
 
 
613 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.77 
 
 
619 aa  221  3.9999999999999997e-56  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
585 aa  220  5e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0654  two-component sensor histidine kinase PhoR  31.88 
 
 
591 aa  219  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 
489 aa  219  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  36.16 
 
 
537 aa  218  4e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.88 
 
 
444 aa  217  5.9999999999999996e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
609 aa  216  7e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 
581 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
607 aa  215  1.9999999999999998e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 
600 aa  214  3.9999999999999995e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0081  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
571 aa  213  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4318  phosphate regulon sensor protein  27.52 
 
 
587 aa  212  2e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4713  sensory box histidine kinase PhoR  27.36 
 
 
587 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4832  sensory box histidine kinase PhoR  27.52 
 
 
587 aa  211  4e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.714625  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.06 
 
 
585 aa  211  4e-53  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4703  sensory box histidine kinase PhoR  27.52 
 
 
587 aa  211  4e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.53621e-18 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.02 
 
 
612 aa  210  5e-53  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.61 
 
 
623 aa  209  8e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0540  sensory box histidine kinase PhoR  27.36 
 
 
587 aa  209  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000110325 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  27.59 
 
 
587 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4329  phosphate regulon sensor protein  27.69 
 
 
587 aa  209  1e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  27.36 
 
 
587 aa  209  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 
587 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.89 
 
 
473 aa  207  3e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4483  sensory box histidine kinase PhoR  27.36 
 
 
587 aa  207  4e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.54 
 
 
587 aa  207  6e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2010  sensory box histidine kinase  29.18 
 
 
571 aa  206  1e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
608 aa  204  3e-51  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1996  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 
456 aa  203  7e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.113749  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1728  sensory box histidine kinase  29 
 
 
571 aa  203  9e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00635742  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
589 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.2 
 
 
633 aa  201  1.9999999999999998e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1137  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.51 
 
 
412 aa  201  5e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000397625  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2989  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.81 
 
 
585 aa  200  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.461641 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.51 
 
 
621 aa  197  4.0000000000000005e-49  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.76 
 
 
589 aa  197  4.0000000000000005e-49  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.3 
 
 
593 aa  197  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.35 
 
 
594 aa  197  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.94 
 
 
453 aa  197  6e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1175  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.61 
 
 
412 aa  196  9e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0245607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 
815 aa  196  9e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.52 
 
 
418 aa  195  2e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.33 
 
 
596 aa  194  4e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
582 aa  192  2e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
608 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2107  histidine kinase  31.44 
 
 
598 aa  191  2.9999999999999997e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  29.95 
 
 
608 aa  191  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.26 
 
 
460 aa  190  5.999999999999999e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.35 
 
 
590 aa  190  7e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1659  histidine kinase  32.92 
 
 
594 aa  189  9e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.350157  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 
584 aa  187  3e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1489  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.58 
 
 
422 aa  187  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.0000165567  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  29 
 
 
610 aa  186  8e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2980  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  41.92 
 
 
487 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000876727  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1749  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.4 
 
 
554 aa  183  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1783  PAS sensor protein  30.4 
 
 
554 aa  183  8.000000000000001e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.62815  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.18 
 
 
581 aa  183  9.000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.24 
 
 
608 aa  182  1e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  32.09 
 
 
446 aa  182  2e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1255  sensory box histidine kinase PhoR  30.9 
 
 
565 aa  180  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  29.91 
 
 
581 aa  180  7e-44  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.17 
 
 
595 aa  179  1e-43  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.99 
 
 
614 aa  179  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>