More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0609 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0609  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 652 aa  1336    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  34.58 
 
 		 644 aa  377  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  34.31 
 
 		 673 aa  373  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  34.36 
 
 		 643 aa  370  1e-101  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  33.58 
 
 		 643 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  33.68 
 
 		 626 aa  367  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  34.78 
 
 		 617 aa  365  1e-99  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  33.58 
 
 		 605 aa  364  3e-99  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  33.53 
 
 		 632 aa  363  6e-99  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  33.78 
 
 		 623 aa  362  1e-98  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  33.78 
 
 		 623 aa  362  1e-98  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  36.09 
 
 		 637 aa  362  1e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  34.17 
 
 		 600 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  34.65 
 
 		 641 aa  362  2e-98  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  33.91 
 
 		 682 aa  361  2e-98  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 		 620 aa  355  1e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  33.48 
 
 		 632 aa  355  2e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  32.63 
 
 		 648 aa  350  4e-95  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  32.93 
 
 		 621 aa  350  6e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  33.73 
 
 		 611 aa  344  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  34.19 
 
 		 598 aa  342  1e-92  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  32.64 
 
 		 661 aa  339  9.999999999999999e-92  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  31.79 
 
 		 636 aa  337  2.9999999999999997e-91  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  31.18 
 
 		 623 aa  328  2.0000000000000001e-88  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  32.35 
 
 		 641 aa  325  1e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  30.13 
 
 		 632 aa  320  5e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  31.91 
 
 		 691 aa  320  7e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  30.88 
 
 		 661 aa  318  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  31.63 
 
 		 629 aa  318  1e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  29.99 
 
 		 633 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  30.13 
 
 		 632 aa  317  4e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  31.72 
 
 		 630 aa  317  4e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  33.43 
 
 		 600 aa  317  4e-85  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  32.06 
 
 		 684 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  32.06 
 
 		 684 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  32.06 
 
 		 684 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  32.06 
 
 		 684 aa  316  8e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  32.06 
 
 		 684 aa  316  8e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  31.76 
 
 		 681 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  31.04 
 
 		 661 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  31.65 
 
 		 705 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  31.39 
 
 		 661 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  29.04 
 
 		 635 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  31.37 
 
 		 616 aa  313  3.9999999999999997e-84  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  30.93 
 
 		 655 aa  311  2e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  30.36 
 
 		 647 aa  310  5e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  30.75 
 
 		 628 aa  309  9e-83  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  31.26 
 
 		 635 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  30.64 
 
 		 681 aa  307  3e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  31.89 
 
 		 636 aa  307  4.0000000000000004e-82  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  30.56 
 
 		 652 aa  306  8.000000000000001e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  31.63 
 
 		 606 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  33.58 
 
 		 610 aa  300  4e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  30.96 
 
 		 606 aa  300  4e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  29.86 
 
 		 687 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  30.56 
 
 		 644 aa  296  7e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  31.21 
 
 		 692 aa  295  2e-78  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  29.65 
 
 		 660 aa  292  1e-77  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1696  DNA mismatch repair protein MutL  30.74 
 
 		 665 aa  291  3e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.930861  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  31.28 
 
 		 680 aa  290  7e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  30.65 
 
 		 628 aa  289  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  29.88 
 
 		 608 aa  286  9e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  30.81 
 
 		 645 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  29.84 
 
 		 669 aa  285  1.0000000000000001e-75  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  30.81 
 
 		 626 aa  285  1.0000000000000001e-75  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  31.23 
 
 		 582 aa  282  1e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  31.22 
 
 		 695 aa  278  3e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  29.41 
 
 		 670 aa  278  3e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  30.47 
 
 		 647 aa  275  1.0000000000000001e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  29.47 
 
 		 607 aa  271  2.9999999999999997e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  28.95 
 
 		 626 aa  267  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  30.87 
 
 		 656 aa  267  5e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  38.97 
 
 		 599 aa  265  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  38.62 
 
 		 603 aa  264  3e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  30.1 
 
 		 659 aa  263  8.999999999999999e-69  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  30.52 
 
 		 602 aa  262  1e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  29.18 
 
 		 668 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  38.36 
 
 		 603 aa  262  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  39.32 
 
 		 597 aa  262  2e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  36.1 
 
 		 602 aa  262  2e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  37.01 
 
 		 612 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  29.18 
 
 		 651 aa  261  4e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  27.74 
 
 		 582 aa  259  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  39.94 
 
 		 610 aa  259  1e-67  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1359  DNA mismatch repair protein  29.03 
 
 		 674 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.52416  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1172  DNA mismatch repair protein  29.69 
 
 		 674 aa  259  1e-67  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  39.32 
 
 		 618 aa  258  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  39.66 
 
 		 616 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  40.88 
 
 		 621 aa  257  6e-67  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  38.97 
 
 		 597 aa  256  8e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  28.49 
 
 		 628 aa  256  9e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  39.03 
 
 		 595 aa  256  1.0000000000000001e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  41.34 
 
 		 608 aa  255  2.0000000000000002e-66  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  28.17 
 
 		 644 aa  253  5.000000000000001e-66  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2328  DNA mismatch repair protein MutL  27.62 
 
 		 629 aa  253  1e-65  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  28.63 
 
 		 640 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  29.26 
 
 		 631 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  41.18 
 
 		 671 aa  250  4e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  27.99 
 
 		 605 aa  250  6e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1174  hypothetical protein  29.98 
 
 		 628 aa  249  8e-65  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0643431 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>