More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_1527 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_1527  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 343 aa  684    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5199  sensor histidine kinase  34.28 
 
 		 341 aa  212  7e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0116  sensor histidine kinase  35.82 
 
 		 337 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0322042  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0118  sensor histidine kinase  35.76 
 
 		 337 aa  196  7e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.151918  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0837  sensor histidine kinase  32.93 
 
 		 336 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0398077  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1081  histidine kinase  32.17 
 
 		 346 aa  181  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.837913 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0831  sensor histidine kinase  32.63 
 
 		 336 aa  179  8e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0938177  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03370  signal transduction histidine kinase  29.12 
 
 		 347 aa  177  3e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3484  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.13 
 
 		 340 aa  169  7e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4726  sensor histidine kinase  32.44 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4568  sensor histidine kinase  32.44 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00420124  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4588  sensor histidine kinase  32.44 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.868097  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5088  sensor histidine kinase  32.44 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4962  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0271  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 340 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4990  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4678  histidine kinase  31.85 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4949  sensor histidine kinase  32.14 
 
 		 340 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4977  sensor histidine kinase  31.85 
 
 		 340 aa  166  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2323  histidine kinase  34.52 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0514446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0522  histidine kinase  31.19 
 
 		 331 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1416  histidine kinase  27.73 
 
 		 342 aa  159  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.122743  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4183  sensor histidine kinase  32 
 
 		 370 aa  157  3e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4172  two-component sensor histidine kinase  32.5 
 
 		 370 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.420668  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4530  sensor histidine kinase  30.86 
 
 		 370 aa  156  6e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.742104  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4571  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 360 aa  155  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1309  sensor histidine kinase  35.12 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000599634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4284  histidine kinase  31.43 
 
 		 360 aa  152  8e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.895654  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4518  sensor histidine kinase  31.29 
 
 		 353 aa  152  8e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2176  histidine kinase  30.41 
 
 		 368 aa  152  8.999999999999999e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2656  sensor protein YxdK  32.74 
 
 		 327 aa  151  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0494  histidine kinase  29.51 
 
 		 340 aa  151  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.752547  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2344  sensor histidine kinase  32.25 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00230354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2379  two-component sensor histidine kinase  32.25 
 
 		 334 aa  149  7e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00984637  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2753  sensor histidine kinase  35.42 
 
 		 279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000130626 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0678  sensor histidine kinase  31.44 
 
 		 353 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00238999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2539  histidine kinase  32.43 
 
 		 327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2305  histidine kinase  33.54 
 
 		 328 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000217968  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2571  sensor protein YxdK  35.89 
 
 		 276 aa  147  3e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.86964  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2618  sensor histidine kinase, putative  31.64 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0136174  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2615  sensor histidine kinase  32.89 
 
 		 327 aa  147  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000946507 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4335  histidine kinase-like ATPase  31.99 
 
 		 321 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3153  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32 
 
 		 360 aa  144  2e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1092  histidine kinase  34.68 
 
 		 303 aa  144  2e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2421  sensor histidine kinase, C-terminal  38.99 
 
 		 252 aa  142  9e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.208231  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4556  sensor histidine kinase  31.14 
 
 		 353 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.590785  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.89 
 
 		 350 aa  137  2e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1788  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 		 326 aa  136  6.0000000000000005e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.841389  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0835  Signal transduction histidine kinase  28.97 
 
 		 331 aa  136  7.000000000000001e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0874026  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2113  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 		 341 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0313  sensor histidine kinase  28.93 
 
 		 346 aa  134  3e-30  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0698  ATPase domain-containing protein  31.75 
 
 		 346 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.541747  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0683  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 		 346 aa  133  3e-30  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.132473  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1909  Signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 		 291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0656  sensor histidine kinase, putative  30.18 
 
 		 357 aa  116  6e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0734197  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2205  sensor histidine kinase, putative  31.94 
 
 		 301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1236  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 350 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2703  ATPase domain-containing protein  28.64 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2647  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.64 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0977  sensor histidine kinase  32.3 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0850  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.04 
 
 		 438 aa  107  4e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0129  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  29.68 
 
 		 465 aa  106  5e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00105437  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.26 
 
 		 590 aa  104  3e-21  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3779  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  25.62 
 
 		 920 aa  102  1e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0439  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.27 
 
 		 500 aa  99.4  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.726141  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1969  histidine kinase  25 
 
 		 463 aa  97.4  3e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1524  Signal transduction histidine kinase  24.84 
 
 		 517 aa  97.8  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.13171  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.26 
 
 		 608 aa  96.7  5e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.63 
 
 		 596 aa  96.3  7e-19  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 		 582 aa  95.9  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0957  Signal transduction histidine kinase  28.53 
 
 		 355 aa  95.9  9e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.84 
 
 		 599 aa  94.7  2e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.88 
 
 		 590 aa  94.4  2e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2782  histidine kinase  28.63 
 
 		 257 aa  95.1  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0436  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 		 595 aa  94  4e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.437679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.75 
 
 		 597 aa  93.2  6e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  30.7 
 
 		 906 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.03 
 
 		 335 aa  92.8  8e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.197055  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0440  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.67 
 
 		 466 aa  92  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000011534  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09300  histidine kinase  22.89 
 
 		 415 aa  92.4  1e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2823  osmosensitive K+ channel signal transduction histidine kinase  25.43 
 
 		 901 aa  92.4  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0538  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  26.14 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.331453  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  26.61 
 
 		 597 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8287  histidine kinase  22.98 
 
 		 386 aa  91.3  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.526532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1846  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.69 
 
 		 463 aa  90.1  4e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000887504  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2475  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.16 
 
 		 585 aa  89.7  6e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.130335  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0236  histidine kinase  24.18 
 
 		 935 aa  89.7  6e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00442274 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0201  histidine kinase  25.75 
 
 		 347 aa  90.1  6e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.370904  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1373  histidine kinase  32.21 
 
 		 541 aa  89.7  7e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000714338  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.37 
 
 		 932 aa  89.4  8e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1674  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 535 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0433443  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.64 
 
 		 535 aa  89.4  9e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2232  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.69 
 
 		 433 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 597 aa  89  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2323  histidine kinase  27.47 
 
 		 497 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2826  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.81 
 
 		 453 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2700  histidine kinase  26.37 
 
 		 468 aa  88.2  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.52 
 
 		 608 aa  88.6  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 		 633 aa  87.8  2e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>