More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_0268 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  100 
 
 		 738 aa  1500    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  28.36 
 
 		 756 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  28.63 
 
 		 674 aa  201  3e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  26.51 
 
 		 946 aa  190  8e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  30.85 
 
 		 679 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  23.89 
 
 		 722 aa  183  8.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  27.76 
 
 		 720 aa  180  9e-44  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  26.18 
 
 		 719 aa  179  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  25.72 
 
 		 684 aa  176  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  25.59 
 
 		 796 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  27.55 
 
 		 723 aa  145  4e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  21.1 
 
 		 774 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  23.15 
 
 		 784 aa  124  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  23.4 
 
 		 783 aa  123  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  22.35 
 
 		 773 aa  120  9.999999999999999e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  26.29 
 
 		 994 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  25.82 
 
 		 774 aa  98.6  4e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  33 
 
 		 771 aa  97.8  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  36.84 
 
 		 997 aa  83.6  0.00000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  36.67 
 
 		 987 aa  83.6  0.00000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  35.46 
 
 		 971 aa  79.7  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  34.04 
 
 		 989 aa  75.5  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0125  histidine kinase  25.08 
 
 		 498 aa  70.1  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6097  histidine kinase  31.75 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.783658  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0114  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.94 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  24.4 
 
 		 587 aa  68.9  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1333  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 441 aa  68.2  0.0000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18234  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  34.72 
 
 		 698 aa  67.8  0.0000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2979  histidine kinase  24.09 
 
 		 622 aa  67.4  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0797138 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2632  signal transduction histidine kinase regulating citrate/malate metabolism  33.13 
 
 		 291 aa  67  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0111  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.55 
 
 		 497 aa  66.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0717737  normal  0.992757 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0589  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 		 520 aa  65.9  0.000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0107  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  24.75 
 
 		 497 aa  65.9  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0249  histidine kinase  25.22 
 
 		 459 aa  65.9  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2360  histidine kinase  29.41 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2718  histidine kinase  23.42 
 
 		 623 aa  65.1  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  26.24 
 
 		 662 aa  63.9  0.000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  26.29 
 
 		 651 aa  63.5  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2273  sensor histidine kinase  25 
 
 		 377 aa  62.8  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1831  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.18 
 
 		 793 aa  63.2  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.836817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0775  sensor histidine kinase  26.2 
 
 		 674 aa  62.4  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3259  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  23.89 
 
 		 622 aa  62  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.157895  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  27.78 
 
 		 661 aa  61.6  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4177  histidine kinase  24.09 
 
 		 620 aa  61.6  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.661658  normal  0.571454 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 		 919 aa  61.6  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2240  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  32.97 
 
 		 609 aa  61.6  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1124  histidine kinase  26.15 
 
 		 483 aa  61.2  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.7316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3813  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  24.04 
 
 		 963 aa  60.8  0.00000008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000539796  normal  0.0501343 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2495  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  31.13 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  27.22 
 
 		 671 aa  60.8  0.00000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0073  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.52 
 
 		 505 aa  60.5  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0372  histidine kinase  23.83 
 
 		 505 aa  60.1  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1499  flagellar regulatory protein B  26.16 
 
 		 431 aa  60.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.440819  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3060  ATPase domain-containing protein  25.31 
 
 		 625 aa  60.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457203  normal  0.839364 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  26.42 
 
 		 468 aa  60.5  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2564  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 559 aa  60.8  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.382353  hitchhiker  0.0000221302 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3479  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  27.35 
 
 		 621 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  25.76 
 
 		 361 aa  60.5  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1337  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 453 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.154373  hitchhiker  0.00314731 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1402  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 		 453 aa  60.5  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0809579 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2932  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 394 aa  59.7  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000651793  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2847  nitrogen regulation protein NtrY, putative  28.42 
 
 		 734 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2325  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 372 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.288819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2137  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2075  sensor histidine kinase (sporulation kinase A)  33.01 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.114358  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2071  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.939444  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2291  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0937  histidine kinase  33.33 
 
 		 471 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2400  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 372 aa  60.1  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0498  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.77 
 
 		 399 aa  59.7  0.0000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2316  sensor histidine kinase  33.01 
 
 		 377 aa  59.7  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1412  sensor histidine kinase/response regulator  22.42 
 
 		 737 aa  58.9  0.0000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.281366  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2248  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.68 
 
 		 936 aa  58.9  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.237382  normal  0.945372 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1544  ATP-binding region ATPase domain protein  23.71 
 
 		 1710 aa  58.5  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3284  histidine kinase  24.9 
 
 		 625 aa  58.2  0.0000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1615  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.38 
 
 		 370 aa  58.2  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0049  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  25.57 
 
 		 365 aa  58.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2939  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.924574  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0733  histidine kinase  28.48 
 
 		 1347 aa  58.2  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1247  histidine kinase  37.5 
 
 		 546 aa  58.2  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3071  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.429893 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1617  multi-sensor signal transduction histidine kinase  22.02 
 
 		 763 aa  58.2  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1434  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.14 
 
 		 713 aa  57.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2929  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 		 360 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03680  nitrogen regulation protein ntrY  24.73 
 
 		 470 aa  57.8  0.0000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.177814  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1662  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  26.41 
 
 		 396 aa  57.8  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  29.91 
 
 		 408 aa  57.4  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0142  histidine kinase  23.53 
 
 		 614 aa  57.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0655  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  25.36 
 
 		 542 aa  57.8  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000210229  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0186  GAF sensor signal transduction histidine kinase  25.54 
 
 		 857 aa  57.8  0.0000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1123  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  30 
 
 		 393 aa  57.8  0.0000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.25113 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1970  sensory box histidine kinase  34.69 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.645732  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2769  signal transduction histidine kinase  25 
 
 		 484 aa  57.4  0.0000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.678535  normal  0.666282 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3202  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  22.54 
 
 		 391 aa  57.4  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1665  sensory box sensor histidine kinase, putative  33.76 
 
 		 403 aa  57  0.000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  31.19 
 
 		 673 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3935  histidine kinase  24.07 
 
 		 667 aa  57.4  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0448  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  24.11 
 
 		 519 aa  57  0.000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>