43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1589 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  100 
 
 		 698 aa  1436    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  28.61 
 
 		 651 aa  106  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  29.58 
 
 		 662 aa  94.4  7e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  30.54 
 
 		 671 aa  75.1  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  41.75 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  34.72 
 
 		 738 aa  67.8  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  37.4 
 
 		 673 aa  63.9  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  32.97 
 
 		 587 aa  61.6  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0570  ATPase domain-containing protein  32.28 
 
 		 720 aa  59.7  0.0000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.208854  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  39.25 
 
 		 609 aa  57.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0749  histidine kinase  32.54 
 
 		 722 aa  56.2  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  33.33 
 
 		 774 aa  55.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  36.36 
 
 		 723 aa  55.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  34.15 
 
 		 684 aa  53.5  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  33.33 
 
 		 971 aa  51.6  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  31.19 
 
 		 679 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  36.45 
 
 		 674 aa  50.4  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  30.16 
 
 		 774 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  30.7 
 
 		 667 aa  49.3  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  32 
 
 		 771 aa  48.1  0.0005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  26.19 
 
 		 946 aa  48.1  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4208  ATP-binding region ATPase domain protein  27.72 
 
 		 589 aa  48.1  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.136628  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1497  ATPase domain-containing protein  29.1 
 
 		 945 aa  48.1  0.0006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.0028368  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  30.84 
 
 		 860 aa  47.8  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0435  ATP-binding region ATPase domain protein  30.94 
 
 		 640 aa  47  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  26.95 
 
 		 796 aa  47  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0911  hypothetical protein  30.77 
 
 		 561 aa  45.8  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00412972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2739  putative DNA mismatch repair protein  33.04 
 
 		 660 aa  46.6  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.281456  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  25.61 
 
 		 756 aa  45.4  0.003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0243  heat shock protein 90  26.7 
 
 		 650 aa  45.8  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  30.94 
 
 		 651 aa  45.1  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  27.43 
 
 		 682 aa  45.1  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1982  metal dependent phosphohydrolase  29.6 
 
 		 814 aa  45.1  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0121434  decreased coverage  0.00400168 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  27.59 
 
 		 652 aa  45.1  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  30.43 
 
 		 702 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  31.3 
 
 		 987 aa  44.3  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1609  heat shock protein 90  30.94 
 
 		 630 aa  44.7  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1771  heat shock protein 90  28.57 
 
 		 633 aa  44.3  0.007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000171528  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0416  heat shock protein 90  28.57 
 
 		 633 aa  44.3  0.007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000647765  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  33.05 
 
 		 773 aa  44.3  0.008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  30 
 
 		 651 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  30.97 
 
 		 719 aa  43.9  0.009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  29.29 
 
 		 647 aa  43.9  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>