81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_3853 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_2202  DNA mismatch repair ATPase-like protein  80.77 
 
 		 651 aa  1083    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  decreased coverage  0.000849326  normal  0.525867 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  100 
 
 		 662 aa  1343    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1182  hypothetical protein  73.3 
 
 		 671 aa  958    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.0023926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  36.83 
 
 		 673 aa  362  1e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0529  hypothetical protein  40.65 
 
 		 609 aa  259  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.320462  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1643  hypothetical protein  28.42 
 
 		 361 aa  114  5e-24  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1589  hypothetical protein  29.58 
 
 		 698 aa  94.4  7e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.242692  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4308  hypothetical protein  25.04 
 
 		 702 aa  90.5  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0554257  normal  0.0504363 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0961  hypothetical protein  26.74 
 
 		 587 aa  83.2  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.598783  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4048  histidine kinase  27.98 
 
 		 773 aa  71.2  0.00000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.219479  normal  0.803154 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4222  hypothetical protein  24.88 
 
 		 640 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0268  histidine kinase  26.24 
 
 		 738 aa  63.9  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2516  putative prophage encoded two-component system histidine kinase  27.94 
 
 		 774 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222494  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2441  histidine kinase  30 
 
 		 674 aa  62.4  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459087  unclonable  0.00000000106284 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3949  histidine kinase  27.72 
 
 		 679 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  24.46 
 
 		 946 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  31.34 
 
 		 774 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2655  histidine kinase  25.91 
 
 		 771 aa  57.4  0.0000008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129531  normal  0.0835586 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00320  hypothetical protein  24.4 
 
 		 584 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0019  heat shock protein 90  26.59 
 
 		 631 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1158  hypothetical protein  30.5 
 
 		 971 aa  55.8  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0746072  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2091  hypothetical protein  27.91 
 
 		 642 aa  55.5  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4053  hypothetical protein  37.62 
 
 		 364 aa  54.7  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0504  signal transduction protein, histidine kinase  30.47 
 
 		 997 aa  54.7  0.000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.284164  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3988  hypothetical protein  26.53 
 
 		 682 aa  54.3  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.544109  hitchhiker  0.00814406 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1181  histidine kinase  33.98 
 
 		 719 aa  53.1  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.798724  normal  0.0930045 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4587  histidine kinase  23.88 
 
 		 784 aa  52.4  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0079  histidine kinase  26.77 
 
 		 987 aa  52.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.217254  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1592  heat shock protein 90  27.65 
 
 		 633 aa  52  0.00004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3087  heat shock protein 90  29.55 
 
 		 606 aa  51.6  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1199  ATP-binding region ATPase domain-containing protein  28.37 
 
 		 652 aa  51.6  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3436  hypothetical protein  27.69 
 
 		 667 aa  51.2  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0371  histidine kinase  31.58 
 
 		 989 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0301  histidine kinase  29 
 
 		 994 aa  50.8  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0141  heat shock protein 90  25.87 
 
 		 658 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0358231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5351  heat shock protein 90  27.01 
 
 		 630 aa  50.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.514382 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1062  hypothetical protein  23.67 
 
 		 644 aa  50.1  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.183826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2565  histidine kinase  28.7 
 
 		 796 aa  50.1  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36080  ATP binding/ATPase (HATPase_c) domain-containing protein  26.47 
 
 		 723 aa  49.7  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.785122  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07530  chaperone protein HtpG  29.84 
 
 		 633 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.583875  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5323  histidine kinase  27.07 
 
 		 783 aa  49.3  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.15205 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5377  Heat shock protein Hsp90-like protein  29.01 
 
 		 657 aa  48.5  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09791  heat shock protein 90  30.56 
 
 		 634 aa  48.1  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.275736 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1243  hypothetical protein  30.63 
 
 		 240 aa  48.1  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000596031  hitchhiker  0.000000000136742 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2743  heat shock protein Hsp90  28.57 
 
 		 677 aa  47.8  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  32.06 
 
 		 529 aa  47.8  0.0006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2007  heat shock protein 90  30.28 
 
 		 652 aa  47.8  0.0007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0072  heat shock protein 90  28.77 
 
 		 626 aa  47.4  0.0008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0306  heat shock protein 90  30.56 
 
 		 634 aa  47.4  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0856617  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0260  heat shock protein 90  26.16 
 
 		 627 aa  47.4  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.694865  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0051  heat shock protein 90  26.24 
 
 		 629 aa  47.4  0.0009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.544882  normal  0.404377 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3158  heat shock protein HtpG  27.85 
 
 		 629 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.705865  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0899  heat shock protein 90  26.74 
 
 		 634 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.460903  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  28.22 
 
 		 605 aa  47  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3155  DNA mismatch repair protein  29.91 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.290609 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2755  heat shock protein Hsp90  27.85 
 
 		 629 aa  47.4  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.613989  hitchhiker  0.00227659 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1998  heat shock protein 90  29.44 
 
 		 666 aa  46.6  0.001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.154063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1575  histidine kinase  30.84 
 
 		 684 aa  47  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.0000414678  decreased coverage  0.0000074807 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12322  heat shock protein 90  26.49 
 
 		 647 aa  47.4  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23829  Heat Shock Protein 90  28 
 
 		 711 aa  47.4  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1764  heat shock protein 90  27.83 
 
 		 615 aa  46.2  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000444601  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4625  histidine kinase  23.76 
 
 		 756 aa  45.8  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.402141 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  23.56 
 
 		 617 aa  46.2  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4127  heat shock protein 90  25.53 
 
 		 669 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.745159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0580  heat shock protein 90  31.79 
 
 		 653 aa  45.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.219902  normal  0.360532 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2208  heat shock protein HtpG  27.67 
 
 		 635 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.741152  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0953  heat shock protein 90  30.64 
 
 		 624 aa  45.1  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.298384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5199  heat shock protein 90  27.97 
 
 		 610 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.661804  normal  0.486638 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15251  heat shock protein 90  24.67 
 
 		 636 aa  44.7  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.339946 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0452  heat shock protein 90  28.3 
 
 		 629 aa  44.7  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5467  heat shock protein 90  31.58 
 
 		 610 aa  44.7  0.006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.306325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6991  heat shock protein Hsp90  23.12 
 
 		 611 aa  44.3  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00854649 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1711  DNA mismatch repair protein MutL  46.81 
 
 		 588 aa  44.3  0.007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.619498  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2480  heat shock protein 90  27.92 
 
 		 640 aa  44.3  0.007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1813  heat shock protein 90  25.6 
 
 		 638 aa  44.3  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.138988  normal  0.331097 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0853  heat shock protein 90  29.76 
 
 		 637 aa  44.3  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.773186  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1817  heat shock protein 90  23.3 
 
 		 651 aa  44.3  0.008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290243  normal  0.0459301 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2017  heat shock protein 90  27.67 
 
 		 637 aa  43.9  0.009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.655724 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4650  heat shock protein 90  23.3 
 
 		 651 aa  43.9  0.009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.865896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1982  metal dependent phosphohydrolase  27.73 
 
 		 814 aa  43.9  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0121434  decreased coverage  0.00400168 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1407  Heat shock protein Hsp90-like protein  30.77 
 
 		 623 aa  43.9  0.01  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>