27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4266 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  100 
 
 		 529 aa  1080    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  38.46 
 
 		 486 aa  318  1e-85  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  37.65 
 
 		 483 aa  296  8e-79  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  36.23 
 
 		 486 aa  273  7e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  33.47 
 
 		 497 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  36.53 
 
 		 494 aa  253  7e-66  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  33.53 
 
 		 502 aa  250  4e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  33.87 
 
 		 520 aa  228  3e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  35.35 
 
 		 500 aa  227  4e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  36.31 
 
 		 436 aa  195  2e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  36.31 
 
 		 438 aa  186  7e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  32.25 
 
 		 537 aa  161  2e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  33.72 
 
 		 538 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  30.51 
 
 		 509 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  30.75 
 
 		 504 aa  128  3e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  24.81 
 
 		 566 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  26.03 
 
 		 575 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  32.95 
 
 		 608 aa  71.2  0.00000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  30.93 
 
 		 629 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  29.21 
 
 		 663 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  31.96 
 
 		 614 aa  48.9  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3853  hypothetical protein  32.06 
 
 		 662 aa  47.8  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.0000936749  normal  0.0170599 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3919  hypothetical protein  27.41 
 
 		 447 aa  46.2  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713535  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17648  predicted protein  31.34 
 
 		 904 aa  44.7  0.004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.571817  normal  0.0825581 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  29.23 
 
 		 615 aa  44.7  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  28.71 
 
 		 630 aa  44.7  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  28.33 
 
 		 616 aa  43.5  0.01  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>