22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_0006 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  68.89 
 
 		 502 aa  688    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  100 
 
 		 497 aa  1016    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  58.46 
 
 		 483 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  55.04 
 
 		 500 aa  494  9.999999999999999e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  41.79 
 
 		 494 aa  330  3e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  36.68 
 
 		 486 aa  280  5e-74  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  34.8 
 
 		 486 aa  262  8.999999999999999e-69  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  33.47 
 
 		 529 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  34.95 
 
 		 520 aa  253  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  34.09 
 
 		 436 aa  189  8e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  37.01 
 
 		 438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  31.07 
 
 		 538 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  32.17 
 
 		 537 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  32.07 
 
 		 504 aa  129  8.000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  30.23 
 
 		 509 aa  114  4.0000000000000004e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  30.52 
 
 		 608 aa  94  5e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  32.24 
 
 		 629 aa  80.1  0.00000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  23.53 
 
 		 575 aa  67.8  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  25.97 
 
 		 566 aa  64.3  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  33.82 
 
 		 663 aa  55.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  34.48 
 
 		 946 aa  46.2  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1489  histidine kinase  48.15 
 
 		 774 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>