22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0277 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  998    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  58.46 
 
 		 497 aa  608  1e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  58.71 
 
 		 502 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  49.69 
 
 		 500 aa  460  9.999999999999999e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  37.65 
 
 		 529 aa  296  7e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  40.97 
 
 		 494 aa  293  6e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  34.29 
 
 		 486 aa  259  1e-67  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  34.55 
 
 		 520 aa  258  2e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  34.24 
 
 		 486 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  33.01 
 
 		 436 aa  206  8e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  35.23 
 
 		 438 aa  198  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  29.31 
 
 		 538 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  31.59 
 
 		 537 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  30.94 
 
 		 504 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  32.42 
 
 		 509 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  34.52 
 
 		 629 aa  77.8  0.0000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  31.68 
 
 		 608 aa  77  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  23.7 
 
 		 566 aa  66.2  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  35.65 
 
 		 663 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  29.73 
 
 		 575 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3783  histidine kinase  35.78 
 
 		 946 aa  49.3  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.377863  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4034  hypothetical protein  22.1 
 
 		 466 aa  44.7  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332359  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>