30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0567 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  100 
 
 		 438 aa  876    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  60.93 
 
 		 436 aa  500  1e-140  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  36.86 
 
 		 538 aa  210  4e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  35.58 
 
 		 483 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  36.31 
 
 		 529 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  33.25 
 
 		 537 aa  186  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  37.01 
 
 		 497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  32.4 
 
 		 486 aa  184  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  36.77 
 
 		 494 aa  177  4e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  38.84 
 
 		 500 aa  176  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  36.9 
 
 		 520 aa  172  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  32.01 
 
 		 486 aa  170  4e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  31.91 
 
 		 502 aa  152  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  33.24 
 
 		 504 aa  121  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  31.44 
 
 		 509 aa  117  3e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  27.98 
 
 		 575 aa  87.8  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  22.1 
 
 		 566 aa  84  0.000000000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  29.49 
 
 		 629 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  26.74 
 
 		 663 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  26.61 
 
 		 608 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  27.68 
 
 		 572 aa  45.8  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1413  hypothetical protein  29.71 
 
 		 780 aa  44.3  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.038685  normal  0.0265607 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  27.27 
 
 		 711 aa  43.9  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  34.74 
 
 		 608 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  37.08 
 
 		 612 aa  43.5  0.007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  32.94 
 
 		 622 aa  43.5  0.007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0890  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0413583 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1788  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2445  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 438 aa  43.1  0.01  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0852041  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>