More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_2458 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1729  DNA mismatch repair protein MutL  62.15 
 
 		 763 aa  811    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3464  DNA mismatch repair protein MutL  55.01 
 
 		 692 aa  689    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2458  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 711 aa  1425    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.593809 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2319  DNA mismatch repair protein MutL  56.01 
 
 		 739 aa  431  1e-119  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0267  DNA mismatch repair protein MutL  58.66 
 
 		 610 aa  383  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1087  DNA mismatch repair protein MutL  56.57 
 
 		 582 aa  356  1e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0917186  normal  0.0241297 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  37.57 
 
 		 705 aa  350  5e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  37.68 
 
 		 684 aa  346  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  37.68 
 
 		 684 aa  346  8e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  37.68 
 
 		 684 aa  346  8e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  37.68 
 
 		 684 aa  346  8e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  37.68 
 
 		 684 aa  346  8e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  34.8 
 
 		 692 aa  333  7.000000000000001e-90  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  34.64 
 
 		 628 aa  320  7.999999999999999e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  48.04 
 
 		 691 aa  287  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  30.84 
 
 		 668 aa  286  9e-76  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  48.55 
 
 		 661 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  48.12 
 
 		 669 aa  284  5.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  48 
 
 		 681 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  48 
 
 		 681 aa  283  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  42.59 
 
 		 615 aa  281  3e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1497  DNA mismatch repair protein MutL  29.44 
 
 		 680 aa  280  6e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.997649  hitchhiker  0.00000153643 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  32.01 
 
 		 639 aa  279  1e-73  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2380  DNA mismatch repair protein MutL  30.31 
 
 		 695 aa  279  1e-73  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  46.43 
 
 		 661 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  46.85 
 
 		 661 aa  278  2e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  29.26 
 
 		 682 aa  277  4e-73  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  46.98 
 
 		 662 aa  278  4e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0701  DNA mismatch repair protein  46.15 
 
 		 635 aa  278  4e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.138509  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3655  DNA mismatch repair protein  46.15 
 
 		 635 aa  277  4e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128216  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3801  DNA mismatch repair protein  46.15 
 
 		 635 aa  277  6e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  46.88 
 
 		 667 aa  276  8e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 		 629 aa  276  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  48.05 
 
 		 625 aa  276  1.0000000000000001e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  46.88 
 
 		 661 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  47.32 
 
 		 653 aa  275  2.0000000000000002e-72  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  45.43 
 
 		 624 aa  274  4.0000000000000004e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  44.36 
 
 		 649 aa  272  1e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  46.13 
 
 		 688 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  44.23 
 
 		 608 aa  272  2e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2779  DNA mismatch repair protein  45.03 
 
 		 652 aa  272  2e-71  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.841115  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  46.01 
 
 		 687 aa  271  4e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  46.43 
 
 		 634 aa  270  5e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5569  DNA mismatch repair protein MutL  29.85 
 
 		 685 aa  270  5.9999999999999995e-71  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.590077  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  45.73 
 
 		 621 aa  270  7e-71  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  42.72 
 
 		 626 aa  270  8e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  46.05 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  46.05 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  45.96 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  46.33 
 
 		 615 aa  270  1e-70  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  46.18 
 
 		 613 aa  269  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  46.05 
 
 		 615 aa  269  1e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  46.33 
 
 		 615 aa  270  1e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  29.58 
 
 		 656 aa  269  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  45.75 
 
 		 613 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  46.05 
 
 		 615 aa  269  2e-70  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  46.05 
 
 		 615 aa  269  2e-70  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  45.01 
 
 		 615 aa  268  2.9999999999999995e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  46.53 
 
 		 619 aa  267  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  48.46 
 
 		 611 aa  267  5e-70  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00096  DNA mismatch repair protein  44.17 
 
 		 681 aa  267  5e-70  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  45.31 
 
 		 607 aa  267  5e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  46.58 
 
 		 636 aa  267  5.999999999999999e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  45.97 
 
 		 647 aa  266  8.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  45.34 
 
 		 607 aa  266  1e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  27.65 
 
 		 669 aa  266  1e-69  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  27.32 
 
 		 645 aa  265  2e-69  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  47.49 
 
 		 635 aa  265  2e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3542  DNA mismatch repair protein  44.63 
 
 		 628 aa  265  2e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0595  DNA mismatch repair protein  34.89 
 
 		 648 aa  265  2e-69  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000232497 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  41.15 
 
 		 629 aa  264  4e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  50 
 
 		 601 aa  264  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  49.54 
 
 		 598 aa  264  4.999999999999999e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  46.22 
 
 		 633 aa  264  4.999999999999999e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00647  DNA mismatch repair protein  41.74 
 
 		 608 aa  263  6e-69  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.893353  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002257  DNA mismatch repair protein MutL  45.37 
 
 		 670 aa  263  6e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.558957  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  48.9 
 
 		 632 aa  263  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  43.93 
 
 		 648 aa  263  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  47.23 
 
 		 636 aa  263  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  45.95 
 
 		 633 aa  263  1e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  44.51 
 
 		 628 aa  262  2e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  42.5 
 
 		 602 aa  261  3e-68  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  47.16 
 
 		 618 aa  261  3e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  49.22 
 
 		 623 aa  261  4e-68  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  44.32 
 
 		 655 aa  261  5.0000000000000005e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  45.35 
 
 		 641 aa  260  7e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  47.73 
 
 		 620 aa  259  8e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0596  DNA mismatch repair protein  34.55 
 
 		 644 aa  260  8e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0279132  decreased coverage  0.0000000183924 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4637  DNA mismatch repair protein  41.5 
 
 		 618 aa  260  8e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000512951  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0776  DNA mismatch repair protein MutL  42.94 
 
 		 755 aa  259  9e-68  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.287224  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4756  DNA mismatch repair protein  41.5 
 
 		 618 aa  259  9e-68  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3434  DNA mismatch repair protein  44.86 
 
 		 644 aa  259  9e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0482547  normal  0.130022 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  47.96 
 
 		 633 aa  259  9e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  48.33 
 
 		 651 aa  259  1e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4627  DNA mismatch repair protein  41.04 
 
 		 618 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  45.76 
 
 		 622 aa  259  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  47.34 
 
 		 632 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4777  DNA mismatch repair protein  46.87 
 
 		 618 aa  259  2e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.00171491  normal  0.0289843 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  28.87 
 
 		 673 aa  258  2e-67  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  48.28 
 
 		 633 aa  258  2e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>