21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_3071 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  100 
 
 		 502 aa  1029    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  68.89 
 
 		 497 aa  715    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  58.71 
 
 		 483 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  52.71 
 
 		 500 aa  466  9.999999999999999e-131  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  41.39 
 
 		 494 aa  325  9e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  33.79 
 
 		 529 aa  261  2e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  34.44 
 
 		 486 aa  257  3e-67  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  33.67 
 
 		 520 aa  246  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  33.12 
 
 		 486 aa  243  7e-63  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  34.49 
 
 		 436 aa  183  7e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  32.85 
 
 		 438 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  30.83 
 
 		 538 aa  157  5.0000000000000005e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  31.25 
 
 		 537 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  30.23 
 
 		 504 aa  125  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  29.8 
 
 		 509 aa  116  1.0000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  28.86 
 
 		 608 aa  81.3  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  35.03 
 
 		 629 aa  71.2  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  22.25 
 
 		 575 aa  70.9  0.00000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  23.35 
 
 		 566 aa  63.5  0.000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  36.36 
 
 		 663 aa  59.3  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  32.77 
 
 		 629 aa  43.5  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>