38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2087 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2087  hypothetical protein  100 
 
 		 500 aa  1003    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.777544  normal  0.0799361 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0006  hypothetical protein  56.45 
 
 		 497 aa  538  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0277  hypothetical protein  51.14 
 
 		 483 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.532467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3071  hypothetical protein  53.31 
 
 		 502 aa  484  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2743  hypothetical protein  40.13 
 
 		 494 aa  288  2e-76  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.128363  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0755  ATPase  37.72 
 
 		 520 aa  276  5e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4266  hypothetical protein  35.63 
 
 		 529 aa  253  5.000000000000001e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2368  hypothetical protein  32.73 
 
 		 486 aa  252  1e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.475897  normal  0.189398 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0934  ATPase  31.61 
 
 		 486 aa  238  2e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0996649  hitchhiker  0.0000000256881 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0757  hypothetical protein  38.01 
 
 		 436 aa  212  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0113754  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0567  hypothetical protein  38.84 
 
 		 438 aa  203  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.602713  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0291  hypothetical protein  32.94 
 
 		 538 aa  156  9e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4751  hypothetical protein  33.04 
 
 		 537 aa  134  3e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.177586  normal  0.857198 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4618  hypothetical protein  30.05 
 
 		 509 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0329503  normal  0.488499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0572  hypothetical protein  31.53 
 
 		 504 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0743  hypothetical protein  23.45 
 
 		 575 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00289763  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2478  hypothetical protein  31.03 
 
 		 566 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000510929  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0595  hypothetical protein  32.99 
 
 		 629 aa  55.8  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8689  hypothetical protein  29.21 
 
 		 663 aa  53.9  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0306  hypothetical protein  25.34 
 
 		 608 aa  53.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0018054  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  34.55 
 
 		 661 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  35.45 
 
 		 687 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1455  hypothetical protein  28.93 
 
 		 860 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.316955 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3539  DNA mismatch repair protein  30.43 
 
 		 644 aa  46.2  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3780  DNA mismatch repair protein  47.62 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0217989 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  47.62 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1432  DNA mismatch repair protein  47.62 
 
 		 647 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.980701 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  28.33 
 
 		 559 aa  45.4  0.002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3867  DNA mismatch repair protein  47.62 
 
 		 647 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  47.62 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  29.9 
 
 		 649 aa  45.8  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  47.62 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3527  DNA mismatch repair protein  47.62 
 
 		 647 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3509  DNA mismatch repair protein  47.62 
 
 		 647 aa  45.4  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  47.62 
 
 		 626 aa  46.2  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  33.33 
 
 		 671 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0684  hypothetical protein  32.48 
 
 		 673 aa  44.3  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.093919  hitchhiker  0.000000000000985329 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  34.31 
 
 		 647 aa  44.3  0.006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>