More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3219 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 		 647 aa  1311    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  39.42 
 
 		 628 aa  449  1e-125  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  38.66 
 
 		 622 aa  429  1e-119  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  39.05 
 
 		 606 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  37.56 
 
 		 602 aa  414  1e-114  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  37.67 
 
 		 607 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  36.8 
 
 		 605 aa  405  1e-111  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  35.81 
 
 		 647 aa  405  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  37.21 
 
 		 607 aa  403  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  37.63 
 
 		 608 aa  402  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  37 
 
 		 608 aa  392  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  37.78 
 
 		 631 aa  388  1e-106  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  37.17 
 
 		 639 aa  388  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  37.02 
 
 		 601 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  35.86 
 
 		 632 aa  382  1e-105  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  34.8 
 
 		 589 aa  380  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  35.81 
 
 		 603 aa  382  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2517  DNA mismatch repair protein  34.18 
 
 		 656 aa  381  1e-104  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2096  DNA mismatch repair protein  36.81 
 
 		 630 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11660  DNA mismatch repair protein MutL  31.95 
 
 		 644 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  38.09 
 
 		 605 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  35 
 
 		 640 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  34.94 
 
 		 628 aa  370  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  33.9 
 
 		 559 aa  372  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  36.56 
 
 		 612 aa  372  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1114  DNA mismatch repair protein MutL  37.35 
 
 		 620 aa  369  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000422632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_978  DNA mismatch repair protein, MutL/HexB family  36.24 
 
 		 566 aa  369  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  35.54 
 
 		 641 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1487  DNA mismatch repair protein MutL  37.6 
 
 		 622 aa  369  1e-100  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.101291  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  35.44 
 
 		 623 aa  367  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2420  DNA mismatch repair protein  33.19 
 
 		 649 aa  365  1e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.323655  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  36.09 
 
 		 605 aa  365  2e-99  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1203  DNA mismatch repair protein  34.69 
 
 		 619 aa  363  6e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.288753  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1195  MutL/HexB family DNA mismatch repair protein  35.3 
 
 		 566 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0321912  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1006  DNA mismatch repair protein MutL  35.15 
 
 		 566 aa  363  7.0000000000000005e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  35.07 
 
 		 632 aa  362  2e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3617  DNA mismatch repair protein  33.83 
 
 		 626 aa  360  5e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.552847  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  33.78 
 
 		 626 aa  360  5e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3904  DNA mismatch repair protein  33.83 
 
 		 626 aa  360  5e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595251  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  34.93 
 
 		 633 aa  360  5e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0481  DNA mismatch repair protein MutL  33.53 
 
 		 623 aa  359  7e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.324517  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  34.93 
 
 		 632 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  35.68 
 
 		 597 aa  357  2.9999999999999997e-97  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3802  DNA mismatch repair protein  33.14 
 
 		 647 aa  357  3.9999999999999996e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.618994  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0963  DNA mismatch repair protein MutL  36.35 
 
 		 608 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0800  DNA mismatch repair protein MutL  35.34 
 
 		 586 aa  356  5.999999999999999e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  34.85 
 
 		 629 aa  356  5.999999999999999e-97  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  34.95 
 
 		 648 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1575  DNA mismatch repair protein MutL  31.78 
 
 		 648 aa  355  1e-96  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  35.01 
 
 		 602 aa  355  2e-96  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  34.38 
 
 		 633 aa  354  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  35.03 
 
 		 635 aa  351  3e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0145  DNA mismatch repair protein  33.19 
 
 		 644 aa  350  3e-95  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3815  DNA mismatch repair protein  33.04 
 
 		 647 aa  351  3e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  34.35 
 
 		 645 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0934  DNA mismatch repair protein  36.13 
 
 		 603 aa  350  5e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.540426 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1981  DNA mismatch repair protein  32.49 
 
 		 626 aa  349  7e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.201794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1217  DNA mismatch repair protein  34.95 
 
 		 612 aa  349  7e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.469734  normal  0.0661873 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  35.11 
 
 		 643 aa  347  3e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  35.4 
 
 		 595 aa  348  3e-94  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  34.39 
 
 		 625 aa  347  3e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  34.66 
 
 		 619 aa  347  3e-94  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  34.77 
 
 		 633 aa  347  4e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  32.94 
 
 		 630 aa  347  4e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  37.16 
 
 		 615 aa  347  5e-94  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  33.23 
 
 		 641 aa  346  8.999999999999999e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0172  DNA mismatch repair protein MutL  33.48 
 
 		 624 aa  345  1e-93  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  34.64 
 
 		 621 aa  345  1e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0864  DNA mismatch repair protein  30.62 
 
 		 645 aa  345  2e-93  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.23826  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  34.9 
 
 		 599 aa  345  2e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  34.62 
 
 		 633 aa  345  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1612  DNA mismatch repair protein  32.31 
 
 		 614 aa  344  2.9999999999999997e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.235254  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  34.92 
 
 		 597 aa  344  2.9999999999999997e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  33.89 
 
 		 611 aa  343  4e-93  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  33.08 
 
 		 630 aa  343  5e-93  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07070  putative DNA mismatch repair protein  32.02 
 
 		 617 aa  343  5.999999999999999e-93  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.748012  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  34.37 
 
 		 574 aa  343  5.999999999999999e-93  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  34.96 
 
 		 603 aa  343  8e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  35.52 
 
 		 603 aa  343  8e-93  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  32.51 
 
 		 692 aa  342  1e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  34.21 
 
 		 575 aa  342  1e-92  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  35.55 
 
 		 616 aa  340  4e-92  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1382  DNA mismatch repair protein  29.51 
 
 		 669 aa  340  5e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0932721  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1078  DNA mismatch repair protein MutL  32.15 
 
 		 572 aa  340  5e-92  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  34.54 
 
 		 626 aa  339  9.999999999999999e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  35.14 
 
 		 594 aa  338  1.9999999999999998e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  35.85 
 
 		 632 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3225  DNA mismatch repair protein MutL  33.08 
 
 		 599 aa  337  2.9999999999999997e-91  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.142793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1924  DNA mismatch repair protein MutL  36.07 
 
 		 560 aa  337  3.9999999999999995e-91  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  34.52 
 
 		 565 aa  337  3.9999999999999995e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  32.98 
 
 		 660 aa  337  5e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  35.55 
 
 		 616 aa  335  1e-90  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  33.64 
 
 		 585 aa  333  4e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  30.95 
 
 		 659 aa  333  7.000000000000001e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0072  DNA mismatch repair protein  31.52 
 
 		 647 aa  333  8e-90  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  32.99 
 
 		 644 aa  332  1e-89  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  34.63 
 
 		 611 aa  332  1e-89  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0526  DNA mismatch repair protein  31.42 
 
 		 668 aa  331  2e-89  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  34.94 
 
 		 605 aa  331  2e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  34.74 
 
 		 618 aa  331  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>