More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CBUD_1186 on replicon NC_009727
Organism: Coxiella burnetii Dugway 5J108-111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
575 aa  1186    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  99.65 
 
 
574 aa  1181    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  50.59 
 
 
611 aa  589  1e-167  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  47.15 
 
 
630 aa  573  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  47.35 
 
 
623 aa  570  1e-161  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  49.08 
 
 
611 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  47.78 
 
 
629 aa  563  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  46.73 
 
 
633 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  46.89 
 
 
633 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  46.89 
 
 
632 aa  557  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  47.13 
 
 
633 aa  558  1e-157  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  46.57 
 
 
632 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  46.71 
 
 
645 aa  553  1e-156  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  46.57 
 
 
633 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  46.49 
 
 
635 aa  554  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  46.74 
 
 
648 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  44.77 
 
 
641 aa  544  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  44.75 
 
 
625 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  43.94 
 
 
630 aa  510  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  45.25 
 
 
616 aa  507  9.999999999999999e-143  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  45.1 
 
 
621 aa  503  1e-141  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  44.07 
 
 
615 aa  499  1e-140  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  44.2 
 
 
619 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  44.41 
 
 
613 aa  501  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  44.32 
 
 
620 aa  495  1e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  44.83 
 
 
628 aa  495  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  43.36 
 
 
598 aa  479  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  42.9 
 
 
622 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  41.52 
 
 
641 aa  464  1e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  42.33 
 
 
604 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  42.21 
 
 
606 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  40.57 
 
 
660 aa  442  1e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  41.25 
 
 
602 aa  442  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  41.61 
 
 
617 aa  442  1e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  39.69 
 
 
644 aa  441  9.999999999999999e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  41.52 
 
 
635 aa  439  9.999999999999999e-123  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  39.45 
 
 
664 aa  438  1e-121  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  41.37 
 
 
595 aa  432  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  41.37 
 
 
595 aa  432  1e-119  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  38.7 
 
 
651 aa  429  1e-119  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  41.54 
 
 
632 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  40.45 
 
 
644 aa  426  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  41.54 
 
 
616 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  40.06 
 
 
626 aa  424  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  39.49 
 
 
620 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  38.91 
 
 
600 aa  417  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  41.03 
 
 
612 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  38.66 
 
 
623 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  38.82 
 
 
594 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  38.66 
 
 
623 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  38.11 
 
 
611 aa  414  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  39.07 
 
 
600 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  40.51 
 
 
618 aa  413  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  39.97 
 
 
610 aa  411  1e-113  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  39.83 
 
 
603 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  40.33 
 
 
597 aa  405  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  37.9 
 
 
643 aa  405  1e-111  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  40.81 
 
 
621 aa  404  1e-111  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  39.47 
 
 
603 aa  401  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  40.17 
 
 
597 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  39.73 
 
 
595 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  37.23 
 
 
603 aa  396  1e-109  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  39.27 
 
 
599 aa  396  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  38.94 
 
 
633 aa  396  1e-109  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  37.82 
 
 
605 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  38.99 
 
 
621 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  37.23 
 
 
603 aa  389  1e-107  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  37.01 
 
 
648 aa  391  1e-107  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  37.34 
 
 
632 aa  392  1e-107  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  36.12 
 
 
617 aa  389  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  36.87 
 
 
622 aa  383  1e-105  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  39.06 
 
 
637 aa  385  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  37.17 
 
 
687 aa  378  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  37.02 
 
 
628 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  36.96 
 
 
606 aa  375  1e-102  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  37.26 
 
 
641 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  42.11 
 
 
624 aa  370  1e-101  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3240  DNA mismatch repair protein MutL  38.09 
 
 
628 aa  365  1e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  52.8 
 
 
644 aa  363  6e-99  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  36.06 
 
 
603 aa  361  2e-98  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  36.75 
 
 
608 aa  361  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  55.72 
 
 
629 aa  360  4e-98  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  56.02 
 
 
649 aa  359  7e-98  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3723  DNA mismatch repair protein  54.07 
 
 
669 aa  359  8e-98  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0150049  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  33.75 
 
 
647 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  52.24 
 
 
636 aa  356  5.999999999999999e-97  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  54.46 
 
 
661 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1083  DNA mismatch repair protein  39.68 
 
 
615 aa  355  1e-96  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  36.21 
 
 
602 aa  355  2e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1951  DNA mismatch repair protein  37.77 
 
 
585 aa  354  2.9999999999999997e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.448925  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  37.06 
 
 
589 aa  353  4e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0336  DNA mismatch repair protein  41.98 
 
 
583 aa  353  5e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00211885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2756  DNA mismatch repair protein  52.81 
 
 
653 aa  353  5.9999999999999994e-96  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.25704  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  39.37 
 
 
615 aa  352  8.999999999999999e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  38.71 
 
 
582 aa  352  1e-95  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0554  DNA mismatch repair protein MutL  37.48 
 
 
565 aa  351  3e-95  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  38.58 
 
 
615 aa  350  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  52.51 
 
 
618 aa  346  5e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  52.69 
 
 
634 aa  346  7e-94  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  38.21 
 
 
613 aa  346  8e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>