More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_0895 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  56.47 
 
 
641 aa  713    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  60.13 
 
 
632 aa  716    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  60.13 
 
 
633 aa  716    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  60.8 
 
 
611 aa  715    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
611 aa  1234    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  59.37 
 
 
633 aa  708    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  58.53 
 
 
645 aa  707    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  56.39 
 
 
634 aa  655    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  58.73 
 
 
648 aa  704    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  57.87 
 
 
635 aa  701    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  60.69 
 
 
641 aa  730    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  59.9 
 
 
633 aa  720    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  57.92 
 
 
625 aa  692    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  57.51 
 
 
630 aa  721    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  55.93 
 
 
644 aa  673    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  60.39 
 
 
629 aa  718    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  57.08 
 
 
636 aa  658    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  60.13 
 
 
623 aa  727    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  59.59 
 
 
633 aa  720    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  60.13 
 
 
632 aa  713    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  57.49 
 
 
626 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  55.06 
 
 
621 aa  627  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  55.07 
 
 
619 aa  625  1e-178  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  49.68 
 
 
630 aa  593  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  50.25 
 
 
574 aa  590  1e-167  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  50.59 
 
 
575 aa  591  1e-167  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  52.27 
 
 
613 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  54.13 
 
 
620 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  52.7 
 
 
628 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  50.81 
 
 
615 aa  568  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  51.23 
 
 
598 aa  563  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  50.7 
 
 
652 aa  554  1e-156  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  49.92 
 
 
616 aa  553  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  50.24 
 
 
617 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  50.15 
 
 
636 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  47.61 
 
 
661 aa  542  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  47.77 
 
 
661 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  49.77 
 
 
647 aa  544  1e-153  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  48.22 
 
 
661 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 
691 aa  533  1e-150  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  50.39 
 
 
655 aa  534  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  49.01 
 
 
635 aa  531  1e-149  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  48.8 
 
 
622 aa  526  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  47.48 
 
 
705 aa  528  1e-148  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  44.6 
 
 
644 aa  502  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  46.78 
 
 
660 aa  500  1e-140  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  48.69 
 
 
604 aa  496  1e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  47.08 
 
 
635 aa  497  1e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  44.63 
 
 
664 aa  482  1e-135  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  45.91 
 
 
595 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  45.91 
 
 
595 aa  476  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  45.58 
 
 
602 aa  470  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  44.46 
 
 
620 aa  469  1.0000000000000001e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  45.2 
 
 
651 aa  468  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  44.06 
 
 
632 aa  466  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  45.15 
 
 
629 aa  462  1e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  45.17 
 
 
603 aa  459  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  42.05 
 
 
623 aa  455  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  42.05 
 
 
623 aa  455  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  44.88 
 
 
594 aa  457  1e-127  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  42.51 
 
 
626 aa  457  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  45.35 
 
 
606 aa  454  1.0000000000000001e-126  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  43.37 
 
 
643 aa  450  1e-125  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  42.68 
 
 
643 aa  451  1e-125  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  46.18 
 
 
603 aa  450  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  47.19 
 
 
612 aa  452  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  47.85 
 
 
632 aa  448  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  47.6 
 
 
616 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  43.64 
 
 
605 aa  441  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  43.12 
 
 
661 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  43.08 
 
 
648 aa  440  9.999999999999999e-123  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  44.9 
 
 
610 aa  438  1e-121  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  42.81 
 
 
633 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  42.63 
 
 
644 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  42.62 
 
 
687 aa  432  1e-120  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  43.52 
 
 
605 aa  431  1e-119  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  41.5 
 
 
600 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  40.45 
 
 
628 aa  429  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  42.26 
 
 
671 aa  430  1e-119  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  41.79 
 
 
600 aa  426  1e-118  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  42.17 
 
 
595 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  43 
 
 
597 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  42.81 
 
 
597 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  43.11 
 
 
621 aa  428  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  46.28 
 
 
615 aa  423  1e-117  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  42.41 
 
 
617 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4412  DNA mismatch repair protein  46.28 
 
 
615 aa  423  1e-117  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0194282  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  46.1 
 
 
615 aa  422  1e-117  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04037  DNA mismatch repair protein  46.1 
 
 
615 aa  419  1e-116  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0484513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  46.1 
 
 
615 aa  419  1e-116  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  46.1 
 
 
615 aa  419  1e-116  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  45.92 
 
 
615 aa  420  1e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  44.76 
 
 
624 aa  422  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  41.91 
 
 
599 aa  421  1e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  44.81 
 
 
621 aa  421  1e-116  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  41 
 
 
603 aa  421  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  38.05 
 
 
611 aa  420  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  44.67 
 
 
618 aa  416  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  45.92 
 
 
615 aa  417  9.999999999999999e-116  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  43.17 
 
 
641 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>