More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA1692 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  56.74 
 
 
629 aa  684    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  56.37 
 
 
632 aa  691    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  100 
 
 
611 aa  1230    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  55.84 
 
 
645 aa  686    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  59.84 
 
 
623 aa  709    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  55.56 
 
 
648 aa  682    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  58.65 
 
 
641 aa  691    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  55.78 
 
 
635 aa  672    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  52.74 
 
 
641 aa  662    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  56.37 
 
 
633 aa  692    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  53.88 
 
 
630 aa  679    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  54.69 
 
 
644 aa  641    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  60.8 
 
 
611 aa  717    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  56.92 
 
 
633 aa  684    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  56.24 
 
 
632 aa  691    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  56.76 
 
 
633 aa  685    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  56.37 
 
 
633 aa  683    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  52.07 
 
 
625 aa  613  9.999999999999999e-175  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  53.47 
 
 
636 aa  611  1e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  53.48 
 
 
626 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  50.4 
 
 
621 aa  572  1.0000000000000001e-162  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  50.08 
 
 
619 aa  565  1e-160  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  49.25 
 
 
574 aa  564  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  49.08 
 
 
575 aa  564  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  50.08 
 
 
628 aa  552  1e-156  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  46.23 
 
 
630 aa  553  1e-156  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  48.79 
 
 
613 aa  550  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  50.32 
 
 
620 aa  540  9.999999999999999e-153  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  47.63 
 
 
615 aa  533  1e-150  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  47.99 
 
 
616 aa  529  1e-149  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  46.73 
 
 
636 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  47.3 
 
 
652 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  47.13 
 
 
655 aa  520  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  46.25 
 
 
635 aa  521  1e-146  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  47.91 
 
 
644 aa  517  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  48.55 
 
 
622 aa  518  1.0000000000000001e-145  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  45.87 
 
 
647 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  47.55 
 
 
660 aa  513  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  47.71 
 
 
598 aa  501  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  44.94 
 
 
661 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  44.63 
 
 
661 aa  499  1e-140  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  46.04 
 
 
635 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  45.37 
 
 
661 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  45.22 
 
 
664 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  47.66 
 
 
604 aa  487  1e-136  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  46.63 
 
 
602 aa  486  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  46.22 
 
 
606 aa  483  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  43.91 
 
 
705 aa  484  1e-135  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  48.85 
 
 
612 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  44.16 
 
 
657 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  46.57 
 
 
632 aa  465  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  44.31 
 
 
657 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  46.67 
 
 
616 aa  464  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  43.17 
 
 
643 aa  461  9.999999999999999e-129  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  44.22 
 
 
651 aa  461  9.999999999999999e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  42.97 
 
 
623 aa  456  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  42.97 
 
 
623 aa  456  1e-127  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  43.78 
 
 
671 aa  457  1e-127  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  42.83 
 
 
626 aa  456  1e-127  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  44.2 
 
 
629 aa  456  1e-127  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  43.33 
 
 
644 aa  458  1e-127  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  43.29 
 
 
632 aa  455  1e-127  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  43.14 
 
 
661 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  43.95 
 
 
621 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  43.36 
 
 
687 aa  451  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  43.37 
 
 
594 aa  449  1e-125  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  44.41 
 
 
641 aa  450  1e-125  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  44.35 
 
 
643 aa  448  1.0000000000000001e-124  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  42.05 
 
 
617 aa  447  1.0000000000000001e-124  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  42.31 
 
 
620 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  42.36 
 
 
595 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  42.36 
 
 
595 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  44.1 
 
 
603 aa  442  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  45.5 
 
 
610 aa  445  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  42.31 
 
 
633 aa  440  9.999999999999999e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  43.99 
 
 
603 aa  434  1e-120  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  45.05 
 
 
621 aa  434  1e-120  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  42.35 
 
 
600 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  43.34 
 
 
597 aa  429  1e-119  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0429  DNA mismatch repair protein  43.2 
 
 
624 aa  432  1e-119  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000237281  hitchhiker  0.000000886041 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  42.23 
 
 
600 aa  431  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  42.79 
 
 
648 aa  430  1e-119  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  41.27 
 
 
605 aa  427  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  42.51 
 
 
597 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0533  DNA mismatch repair protein  43.92 
 
 
629 aa  427  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000857622  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  42.31 
 
 
595 aa  429  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  40.58 
 
 
611 aa  423  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  42.58 
 
 
603 aa  421  1e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  40.09 
 
 
628 aa  420  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0490  DNA mismatch repair protein  42.51 
 
 
649 aa  416  9.999999999999999e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00424491  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4720  DNA mismatch repair protein  42.88 
 
 
618 aa  418  9.999999999999999e-116  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3843  DNA mismatch repair protein  43.56 
 
 
615 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000795964  hitchhiker  0.000000387336 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4641  DNA mismatch repair protein  43.74 
 
 
615 aa  416  9.999999999999999e-116  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.231193  normal  0.0766044 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  41.48 
 
 
599 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0353  DNA mismatch repair protein  44.17 
 
 
613 aa  417  9.999999999999999e-116  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.114284  hitchhiker  0.00160708 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3823  DNA mismatch repair protein MutL  43.38 
 
 
615 aa  413  1e-114  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000414583  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4728  DNA mismatch repair protein  43.38 
 
 
615 aa  413  1e-114  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0929403  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4701  DNA mismatch repair protein  43.38 
 
 
615 aa  412  1e-114  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0915673  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5686  DNA mismatch repair protein  43.21 
 
 
615 aa  415  1e-114  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000161678  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  41.28 
 
 
618 aa  412  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>