More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_2485 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  82.63 
 
 		 684 aa  1089    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  65.45 
 
 		 636 aa  813    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  64.94 
 
 		 647 aa  808    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  82.63 
 
 		 684 aa  1089    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  64.38 
 
 		 652 aa  829    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  82.94 
 
 		 681 aa  1090    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  82.9 
 
 		 661 aa  1082    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  81.83 
 
 		 687 aa  1090    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 691 aa  1393    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  82.63 
 
 		 684 aa  1089    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  83.11 
 
 		 705 aa  1092    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  82.53 
 
 		 688 aa  1100    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  82.65 
 
 		 681 aa  1085    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  82.63 
 
 		 684 aa  1089    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  64.48 
 
 		 655 aa  808    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  83.44 
 
 		 661 aa  1068    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  83.26 
 
 		 667 aa  1077    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  83.06 
 
 		 662 aa  1053    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  83.23 
 
 		 661 aa  1073    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  82.63 
 
 		 684 aa  1089    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  83.26 
 
 		 667 aa  1077    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  82.96 
 
 		 667 aa  1078    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  64.63 
 
 		 635 aa  802    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  51.5 
 
 		 613 aa  623  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  52.53 
 
 		 651 aa  612  9.999999999999999e-175  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  49.39 
 
 		 616 aa  614  9.999999999999999e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  50.91 
 
 		 615 aa  601  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  51.9 
 
 		 628 aa  595  1e-168  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  50.23 
 
 		 622 aa  593  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  50.61 
 
 		 598 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  48.47 
 
 		 660 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  49.39 
 
 		 604 aa  571  1e-161  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  48.71 
 
 		 625 aa  560  1e-158  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  46.07 
 
 		 629 aa  556  1e-157  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  48.01 
 
 		 645 aa  556  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  48.29 
 
 		 633 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  48.14 
 
 		 632 aa  553  1e-156  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  46.08 
 
 		 641 aa  553  1e-156  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  47.7 
 
 		 632 aa  554  1e-156  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  47.56 
 
 		 648 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  48.07 
 
 		 633 aa  548  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  47.89 
 
 		 623 aa  548  1e-154  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  46.69 
 
 		 641 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  47.29 
 
 		 633 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  46.71 
 
 		 633 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  44.94 
 
 		 644 aa  536  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  46.55 
 
 		 635 aa  533  1e-150  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  44.08 
 
 		 630 aa  523  1e-147  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  47.59 
 
 		 636 aa  523  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  46.06 
 
 		 619 aa  515  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  47.42 
 
 		 626 aa  501  1e-140  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  40.24 
 
 		 630 aa  480  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  44.59 
 
 		 617 aa  465  9.999999999999999e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  41.03 
 
 		 602 aa  432  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  40.98 
 
 		 643 aa  430  1e-119  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  40.69 
 
 		 633 aa  415  1e-114  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  39.79 
 
 		 632 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  40.58 
 
 		 643 aa  412  1e-113  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  39.1 
 
 		 594 aa  408  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  38.91 
 
 		 599 aa  402  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  38.55 
 
 		 597 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  38.45 
 
 		 603 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  41.44 
 
 		 629 aa  397  1e-109  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  58.55 
 
 		 657 aa  398  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  38.39 
 
 		 644 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  58.26 
 
 		 657 aa  396  1e-109  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  39.46 
 
 		 626 aa  394  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  59.76 
 
 		 635 aa  395  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  36.3 
 
 		 611 aa  392  1e-107  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  57.8 
 
 		 698 aa  390  1e-107  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  38.12 
 
 		 600 aa  388  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  38.59 
 
 		 620 aa  389  1e-106  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  38.48 
 
 		 637 aa  387  1e-106  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  59.34 
 
 		 687 aa  387  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  38.05 
 
 		 623 aa  384  1e-105  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  38.05 
 
 		 623 aa  384  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  40.38 
 
 		 671 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  39.44 
 
 		 621 aa  385  1e-105  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  38.8 
 
 		 617 aa  381  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  37.44 
 
 		 600 aa  379  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  37.96 
 
 		 602 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  36.72 
 
 		 628 aa  379  1e-104  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  38.96 
 
 		 605 aa  382  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  38.98 
 
 		 661 aa  377  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  38.23 
 
 		 610 aa  376  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  58.59 
 
 		 674 aa  379  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  36.76 
 
 		 647 aa  377  1e-103  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  38.57 
 
 		 687 aa  374  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  38.39 
 
 		 603 aa  375  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  33.93 
 
 		 673 aa  373  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  39.94 
 
 		 648 aa  375  1e-102  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  38.61 
 
 		 632 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  50.62 
 
 		 664 aa  367  1e-100  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  38.31 
 
 		 601 aa  365  1e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  38.24 
 
 		 607 aa  363  8e-99  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2701  DNA mismatch repair protein MutL  34.35 
 
 		 626 aa  361  3e-98  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00383046  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  32.27 
 
 		 608 aa  360  5e-98  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  37.65 
 
 		 607 aa  357  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  32.6 
 
 		 682 aa  357  3.9999999999999996e-97  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3921  DNA mismatch repair protein  37.76 
 
 		 661 aa  351  3e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0286731  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>