More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_1304 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 628 aa  1280    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2001  DNA mismatch repair protein  47.04 
 
 		 606 aa  568  1e-161  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0369313  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1770  DNA mismatch repair protein  47.86 
 
 		 602 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00259733  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0978  DNA mismatch repair protein  45.55 
 
 		 647 aa  558  1e-157  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0100042  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3282  DNA mismatch repair protein  45.58 
 
 		 650 aa  555  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2053  DNA mismatch repair protein  46.73 
 
 		 622 aa  549  1e-155  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00117239  hitchhiker  0.0000000712721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2962  DNA mismatch repair protein  45.28 
 
 		 608 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000126227  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0993  DNA mismatch repair protein  44.02 
 
 		 589 aa  498  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.139394  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2223  DNA mismatch repair protein  42.97 
 
 		 607 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.38556  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1715  DNA mismatch repair protein  42.54 
 
 		 608 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.233899  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  41.18 
 
 		 632 aa  453  1.0000000000000001e-126  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2088  DNA mismatch repair protein  43.61 
 
 		 601 aa  449  1e-125  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.02775 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0149  DNA mismatch repair protein MutL  41.34 
 
 		 605 aa  451  1e-125  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3219  DNA mismatch repair protein MutL  39.42 
 
 		 647 aa  449  1e-125  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.428383  normal  0.251683 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2133  DNA mismatch repair protein  42.2 
 
 		 607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  40.28 
 
 		 623 aa  442  1e-123  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  39.69 
 
 		 621 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  40.79 
 
 		 625 aa  440  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  40.55 
 
 		 619 aa  437  1e-121  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  39.2 
 
 		 641 aa  433  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  40.19 
 
 		 641 aa  433  1e-120  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  39.78 
 
 		 633 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  40.47 
 
 		 629 aa  430  1e-119  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  39.54 
 
 		 633 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  40.51 
 
 		 611 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  40.09 
 
 		 632 aa  431  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  39.26 
 
 		 633 aa  430  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  39.63 
 
 		 632 aa  428  1e-118  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  39.4 
 
 		 630 aa  427  1e-118  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  39.32 
 
 		 644 aa  426  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  41.36 
 
 		 626 aa  428  1e-118  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  39.22 
 
 		 635 aa  423  1e-117  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  40.09 
 
 		 611 aa  420  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  39.26 
 
 		 633 aa  419  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  39.28 
 
 		 645 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  39.87 
 
 		 632 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  38.95 
 
 		 644 aa  416  9.999999999999999e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  39.15 
 
 		 648 aa  415  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1919  DNA mismatch repair protein MutL  38.96 
 
 		 670 aa  412  1e-113  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.770906  hitchhiker  0.00107591 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  39.24 
 
 		 612 aa  410  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  37.83 
 
 		 623 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  37.83 
 
 		 623 aa  405  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  40.63 
 
 		 620 aa  408  1.0000000000000001e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  37.54 
 
 		 613 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  39.4 
 
 		 616 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  39.06 
 
 		 606 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  38.87 
 
 		 636 aa  403  1e-111  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  39.52 
 
 		 603 aa  399  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  38.39 
 
 		 615 aa  399  1e-109  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  39.31 
 
 		 603 aa  397  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  35.15 
 
 		 630 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  37.52 
 
 		 626 aa  396  1e-109  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  38.45 
 
 		 597 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  38.27 
 
 		 602 aa  395  1e-108  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4044  DNA mismatch repair protein MutL  37.89 
 
 		 628 aa  393  1e-108  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0816003  normal  0.310643 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  39.46 
 
 		 616 aa  395  1e-108  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  36.54 
 
 		 643 aa  394  1e-108  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  38.69 
 
 		 597 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  38.51 
 
 		 595 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  35.82 
 
 		 611 aa  394  1e-108  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  38.78 
 
 		 621 aa  392  1e-108  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0157  DNA mismatch repair protein MutL  34.62 
 
 		 559 aa  391  1e-107  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  37.29 
 
 		 647 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  38.47 
 
 		 629 aa  392  1e-107  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1703  DNA mismatch repair protein MutL  36.09 
 
 		 603 aa  391  1e-107  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2999  DNA mismatch repair protein MutL  36.36 
 
 		 631 aa  389  1e-107  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1936  DNA mismatch repair protein MutL  37.88 
 
 		 612 aa  392  1e-107  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000687656 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1884  DNA mismatch repair protein  38.96 
 
 		 640 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  38.8 
 
 		 600 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  38.7 
 
 		 600 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  37.82 
 
 		 594 aa  387  1e-106  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  37.09 
 
 		 635 aa  387  1e-106  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1838  DNA mismatch repair protein MutL  34.78 
 
 		 692 aa  388  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  hitchhiker  0.0019765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  38.12 
 
 		 643 aa  386  1e-106  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  37.91 
 
 		 617 aa  389  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2128  DNA mismatch repair protein  37.31 
 
 		 639 aa  386  1e-106  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000120986  normal  0.021871 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0100  DNA mismatch repair protein MutL  37.97 
 
 		 605 aa  385  1e-105  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  36.23 
 
 		 636 aa  384  1e-105  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  37.93 
 
 		 637 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4548  DNA mismatch repair protein MutL  39.01 
 
 		 605 aa  383  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  37.27 
 
 		 652 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  37.14 
 
 		 661 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  37.41 
 
 		 705 aa  385  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  37.42 
 
 		 603 aa  385  1e-105  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  38.38 
 
 		 605 aa  385  1e-105  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2098  DNA mismatch repair protein  34.76 
 
 		 659 aa  380  1e-104  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  36.66 
 
 		 661 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  37.48 
 
 		 598 aa  381  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  36.69 
 
 		 618 aa  381  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  37.18 
 
 		 610 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  37.62 
 
 		 599 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  36.38 
 
 		 667 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  37.05 
 
 		 620 aa  381  1e-104  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  37.16 
 
 		 661 aa  380  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  36.38 
 
 		 667 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  39.72 
 
 		 641 aa  379  1e-103  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  36.46 
 
 		 691 aa  376  1e-103  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  37.08 
 
 		 574 aa  377  1e-103  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  38.88 
 
 		 603 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  37.02 
 
 		 575 aa  378  1e-103  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>