More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_3209 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_0893  DNA mismatch repair protein MutL  68.14 
 
 
657 aa  854    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.639278  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0978  DNA mismatch repair protein MutL  68.43 
 
 
657 aa  857    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4225  DNA mismatch repair protein MutL  63.56 
 
 
687 aa  785    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.724774  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  60.84 
 
 
604 aa  719    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1125  DNA mismatch repair protein MutL  58.27 
 
 
651 aa  715    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.279862 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3308  DNA mismatch repair protein MutL  69.32 
 
 
664 aa  877    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  100 
 
 
660 aa  1333    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  72.36 
 
 
622 aa  894    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5131  DNA mismatch repair protein MutL  64.71 
 
 
674 aa  818    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  69.85 
 
 
635 aa  844    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  80.34 
 
 
644 aa  1019    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1300  DNA mismatch repair protein MutL  64.24 
 
 
698 aa  830    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0863563  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  52.81 
 
 
636 aa  615  1e-175  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  51.81 
 
 
647 aa  612  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  51.91 
 
 
635 aa  608  9.999999999999999e-173  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  50.95 
 
 
652 aa  601  1e-170  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  50.45 
 
 
655 aa  598  1e-169  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  49.15 
 
 
684 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  49.15 
 
 
684 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  49.15 
 
 
684 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  49.22 
 
 
681 aa  592  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  49.15 
 
 
684 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  49.15 
 
 
684 aa  592  1e-168  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  49.56 
 
 
661 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  49.07 
 
 
681 aa  591  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  49.7 
 
 
661 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  49.85 
 
 
705 aa  591  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  49.33 
 
 
667 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  49.18 
 
 
661 aa  588  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  49.33 
 
 
667 aa  588  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  49.18 
 
 
667 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  49.35 
 
 
691 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  48.85 
 
 
688 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  49.11 
 
 
662 aa  580  1e-164  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  48.34 
 
 
687 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  50.62 
 
 
615 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  49.7 
 
 
625 aa  553  1e-156  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  47.47 
 
 
616 aa  555  1e-156  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  47.6 
 
 
613 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  47.48 
 
 
630 aa  538  1e-151  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  49.24 
 
 
634 aa  535  1e-150  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  46.8 
 
 
629 aa  530  1e-149  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  48.94 
 
 
628 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  48.55 
 
 
632 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  46.87 
 
 
635 aa  524  1e-147  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  46.12 
 
 
644 aa  523  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  48.17 
 
 
633 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  48.56 
 
 
632 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  48.84 
 
 
623 aa  523  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  48.55 
 
 
633 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  46.93 
 
 
645 aa  519  1e-146  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  46.5 
 
 
621 aa  519  1e-146  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  47.07 
 
 
641 aa  519  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  47.55 
 
 
611 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  47.85 
 
 
633 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  47.19 
 
 
648 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  47.55 
 
 
633 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  46.74 
 
 
619 aa  513  1e-144  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  43.83 
 
 
641 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  47.65 
 
 
598 aa  507  9.999999999999999e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  46.54 
 
 
611 aa  502  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  44.56 
 
 
636 aa  493  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  45.61 
 
 
626 aa  469  1.0000000000000001e-131  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  41.55 
 
 
630 aa  461  9.999999999999999e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  40.57 
 
 
575 aa  443  1e-123  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  40.57 
 
 
574 aa  442  9.999999999999999e-123  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  43.16 
 
 
617 aa  438  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  41.36 
 
 
643 aa  424  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  39.51 
 
 
632 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  42.44 
 
 
606 aa  415  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  41.99 
 
 
597 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  42.75 
 
 
612 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  42.15 
 
 
599 aa  402  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  40.85 
 
 
602 aa  403  1e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  40.9 
 
 
594 aa  402  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  41.95 
 
 
603 aa  400  9.999999999999999e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  40 
 
 
597 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  40 
 
 
595 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  40.55 
 
 
620 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  40.92 
 
 
626 aa  402  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  40.28 
 
 
633 aa  401  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  42.37 
 
 
616 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  41.93 
 
 
618 aa  397  1e-109  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  41.12 
 
 
603 aa  398  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  41.62 
 
 
643 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  41.34 
 
 
632 aa  394  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  39.59 
 
 
644 aa  394  1e-108  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  39.81 
 
 
623 aa  391  1e-107  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  40.03 
 
 
595 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  39.81 
 
 
623 aa  391  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  40 
 
 
600 aa  392  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  40.03 
 
 
595 aa  390  1e-107  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  39.69 
 
 
600 aa  385  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  36.76 
 
 
611 aa  380  1e-104  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  40.58 
 
 
621 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  39.76 
 
 
629 aa  380  1e-104  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  40.79 
 
 
621 aa  382  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  40.9 
 
 
648 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  40.34 
 
 
603 aa  377  1e-103  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  39.85 
 
 
610 aa  379  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>