More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2946 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 629 aa  1232    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  59.59 
 
 		 602 aa  668    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  60.15 
 
 		 643 aa  681    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  56.36 
 
 		 644 aa  649    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  58.19 
 
 		 633 aa  660    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  57.35 
 
 		 599 aa  628  1e-179  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  56.6 
 
 		 595 aa  625  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  56.87 
 
 		 597 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  55.45 
 
 		 610 aa  627  1e-178  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  57.03 
 
 		 603 aa  626  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  55.4 
 
 		 606 aa  622  1e-177  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  57.19 
 
 		 603 aa  622  1e-177  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  55.38 
 
 		 597 aa  624  1e-177  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  56.41 
 
 		 618 aa  615  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  54.82 
 
 		 594 aa  605  9.999999999999999e-173  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  52.13 
 
 		 626 aa  602  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  54.75 
 
 		 621 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  53.81 
 
 		 623 aa  600  1e-170  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  55.92 
 
 		 605 aa  598  1e-170  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  53.81 
 
 		 623 aa  600  1e-170  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  56.43 
 
 		 643 aa  601  1e-170  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  53.96 
 
 		 612 aa  594  1e-168  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  52.91 
 
 		 617 aa  593  1e-168  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  52.76 
 
 		 605 aa  590  1e-167  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  52.22 
 
 		 620 aa  592  1e-167  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  52.15 
 
 		 600 aa  588  1e-166  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  55.84 
 
 		 621 aa  584  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  49.45 
 
 		 611 aa  584  1.0000000000000001e-165  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  51.59 
 
 		 600 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  52.62 
 
 		 603 aa  580  1e-164  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  53.75 
 
 		 637 aa  578  1e-164  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  53.24 
 
 		 632 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  52.73 
 
 		 648 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  52.31 
 
 		 687 aa  569  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  52.76 
 
 		 616 aa  567  1e-160  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  52.15 
 
 		 661 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  54.63 
 
 		 641 aa  566  1e-160  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  52.11 
 
 		 671 aa  560  1e-158  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  51.89 
 
 		 603 aa  548  1e-154  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  44.23 
 
 		 608 aa  521  1e-146  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  47.07 
 
 		 632 aa  498  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  39 
 
 		 673 aa  479  1e-134  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  41.03 
 
 		 598 aa  474  1e-132  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  45.77 
 
 		 629 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  42.62 
 
 		 641 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  44.36 
 
 		 632 aa  463  1e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  44.92 
 
 		 611 aa  463  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  41.5 
 
 		 630 aa  462  1e-129  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  45.15 
 
 		 611 aa  464  1e-129  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  43.61 
 
 		 633 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  44.36 
 
 		 633 aa  462  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  44.43 
 
 		 623 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  43.69 
 
 		 632 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  43.45 
 
 		 633 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  43.89 
 
 		 633 aa  456  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  48.17 
 
 		 582 aa  457  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  45.55 
 
 		 625 aa  454  1.0000000000000001e-126  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  43.59 
 
 		 645 aa  450  1e-125  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  44.29 
 
 		 635 aa  452  1e-125  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  42.75 
 
 		 648 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  44.09 
 
 		 641 aa  447  1.0000000000000001e-124  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  41.56 
 
 		 630 aa  442  1e-123  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  42.12 
 
 		 616 aa  442  1e-123  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  42.88 
 
 		 644 aa  444  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  41.18 
 
 		 575 aa  435  1e-120  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  41.02 
 
 		 574 aa  434  1e-120  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  43.73 
 
 		 636 aa  435  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  43.19 
 
 		 615 aa  429  1e-119  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  43.55 
 
 		 598 aa  432  1e-119  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0668  DNA mismatch repair protein MutL  46.68 
 
 		 620 aa  431  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.422126  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  40.51 
 
 		 613 aa  431  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2754  DNA mismatch repair protein  44.78 
 
 		 634 aa  431  1e-119  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679624 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  44.2 
 
 		 621 aa  426  1e-118  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  41.83 
 
 		 652 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1823  DNA mismatch repair protein MutL  43.77 
 
 		 628 aa  422  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.0000270616  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  44.78 
 
 		 619 aa  425  1e-117  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0216  DNA mismatch repair protein  35.31 
 
 		 682 aa  421  1e-116  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0851058  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2908  DNA mismatch repair protein  41.79 
 
 		 655 aa  422  1e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  42.57 
 
 		 661 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  41.19 
 
 		 691 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  43.84 
 
 		 626 aa  415  1e-114  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  41.55 
 
 		 636 aa  410  1e-113  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  42.42 
 
 		 661 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  42.84 
 
 		 705 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  42.11 
 
 		 661 aa  409  1.0000000000000001e-112  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3934  DNA mismatch repair protein  40.96 
 
 		 688 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000834702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  42.49 
 
 		 667 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0750  DNA mismatch repair protein  40.75 
 
 		 687 aa  403  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.536316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  42.49 
 
 		 667 aa  403  1e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  41.29 
 
 		 684 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  41.29 
 
 		 684 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  41.29 
 
 		 684 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  41.63 
 
 		 681 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2015  DNA mismatch repair protein MutL  43.5 
 
 		 617 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1304  DNA mismatch repair protein  39.13 
 
 		 628 aa  399  9.999999999999999e-111  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0761454  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  41.14 
 
 		 647 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  41.29 
 
 		 684 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  41.05 
 
 		 644 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  41.29 
 
 		 684 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2430  DNA mismatch repair protein  40.37 
 
 		 635 aa  400  9.999999999999999e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>